Введение
Глава 1. Задача «структура-свойство» и существующие методы ее решения ... 13
1.1 Общая постановка задачи «структура-свойство» 13
1.1.1 Описание обучающего множества 14
1.1.2 Постановка задачи 17
1.2 Существующие методы описания молекул 20
1.2.1 Параметрическое описание молекул топологическими дескрипторами 21
1.2.2 Параметрическое описание молекул структурными дескрипторами 23
1.2.3 3D-QSAR анализ трехмерных молекул 25
1.3 Методы построения прогнозирующей функции 28
Выводы 30
Глава 2. Метод представления информации о структуре молекул четкими и нечеткими дескрипторами 31
2.1 Постановка задачи в работе 32
2.2 Метод описания молекулярной структуры четкими структурными 3D-дескрипторами 36
2.3 Применение аппарата нечеткой логики при формировании структурных 3D-дескрипторов 41
2.3.1 Нечеткая логика и существующие методы решения задачи «структура-свойство» с помощью нечеткой логики 41
2.3.2 Нечеткие классы особых точек и расстояний 45
2.3.3 Алфавит нечетких структурных 3D-дескрипторов и вычисление их значений 47
2.4 Оптимизация описания нечеткими дескрипторами как демонстрация преимущества нечетких дескрипторов 52
2.4.1 Общая схема алгоритма оптимизации 52
2.4.2 Формирование начального алфавита дескрипторов 53
2.4.3 Оптимизация алфавита дескрипторов с использованием нейронной сети 54
2.5 Алгоритм решения задачи «структура-свойство» с помощью нечетких дескрипторов 57
2.5.1 Эволюционный отбор 58
2.5.2 Описание алгоритма 60
2.6 Оценка вычислительной сложности 64
Выводы 69
Глава 3. Экспериментальные результаты 71
3.1 Программная реализация алгоритма 71
3.1.1 Построение молекулярной поверхности, особых точек 71
3.1.2 Формирование матрицы «молекула-признак» и поиск классифицирующей функции в среде MATLAB 76
3.2 Использованные методы построения классифицирующей функции 77
3.3 Описание результатов 84
3.3.1 Обработка выборки бициклических бисмочевин 85
3.3.2 Обработка выборки гликозидов 95
Выводы 106
Заключение 108
Приложение.
Литература 117
