Введение
ГЛАВА 1. Обзор литературы 22
1.1. Элементы генома вирусного происхождения и их роль в процессе онкогенеза 22
1.2. Таксономия ретровирусов 28
1.2.1. Репликативный цикл ретровируса типа D Мейзона- Пфайзера 29
1.2.2. Организация генома вируса Мейзона-Пфайзера 33
1.2.3. Ассоциация вируса Мейзона-Пфайзера с патологией человека 40
1.3. Вирус Эпштейна-Барр 44
1.3.1. Геном вируса Эпштейна-Барр 45
1.3.2. Полиморфизм генома ВЭБ 46
1.3.3. Гены литической инфекции ВЭБ 48
1.3.4. Гены латентной инфекции ВЭБ 49
1.3.5. Трансформирующая функция белков латентной инфекции ВЭБ 52
1.3.6. Строение и функции белка EBNA-3C 54
1.3.7. Ассоциация ВЭБ с развитием злокачественных заболеваний 57
1.4. Вирусы папиллом человека 60
1.4.1. Организация генома ВПЧ 62
1.4.2. Патогенез ВПЧ 63
1.4.3. Роль ВПЧ в развитии онкологических заболеваний органов мочеполовой системы 66
1.5. Генетическая предрасположенность к развитию онкологических заболеваний 69
1.6. Роль генетических факторов в развитии поздних гестозов беременных 73
1.7. Молекулы клеточной адгезии 76
1.7.1. Структурная модель интегринов 77
1.7.2. Интегриныи сигналинг 80
1.7.3. Гликопротеиновый комплекс GPIIb-GPIIIa Полиморфизм аллоантигенной системы тромбоцитов РЦА) 82
1.7.4. Роль гликопротеинового комплекса GPIIb-GPIIIa в развитии атеросклероза 85
1.7.5. Роль интегринов в эмбриогенезе 86
1.7.6. Роль интегринов в развитии опухолей 88
1.8. Гены системы метаболизма этанола 93
1.8.1. Популяционные различия полиморфизма генов системы метаболизма этанола 96
1.8.2. Полиморфизм ферментов метаболизма этанола и риск развития алкогольной патологии 99
ГЛАВА 2. Материалы и методы исследований 104
ГЛАВА 3. Результаты и обсуждение. 138
3.1. Исследование элементов генома вирусного происхождения. 138
3.1.1. Детекция ДНК вируса Эпштейн-Барр в клетках периферической крови методом ПЦР . 138
3.1.2. Полиморфный элемент гена EBNA-3C вируса Эпштейн-Барр 144
3.2. Интеграция ретровируса типа D Мейзона - Пфайзера в хромосомы человека 153
3.2.1. Амплификация методом селективной ПЦР- супрессии концевых участков вирусной ДНК и прилегающих участков ДНК человека 153
3.2.2. Гибридизация по Саузерну продуктов ПНР, содержащих концевые участки вирусной ДНК и прилегающие участки ДНК человека 157
3.2.3. Создание библиотеки клонов 159
3.2.4. Скрининг бибилиотеки и селекция клонов, содержащих концевые участки вирусной ДНК и
прилегающие участки генома человека 160
3.2.5. Анализ нуклеотидной последовательности вставки рекомбинантного клона 51 164
3.2.6. Подтверждение наличия LTR вируса Мейзона-
Пфайзера в 17-ой хромосоме человека 166
3.2.7. Анализ сайтов интеграции последовательностей вируса Мейзона-Пфайзера в хромосомы человека 171
3.2.8. Характеристика участков разрывов LTR вируса 174
3.2.9. Функциональная характеристика участков генома человека, в которые произошла интеграция MPMV 176
3.2.10. Обсуждение результатов раздела 3.2. 179
3.3. Детекция элементов генома вируса папилломы человека типа 16 в клетках опухолей и периферической крови пациентов, страдающих раком мочевого пузыря. 183
3.3.1. Анализ ДНК, выделенной из клеток 183
периферической крови пациентов с первичными опухолями органов мочеполовой системы, методом ПТТР.
3.3.2. Исследование биопсийных препаратов опухолей мочевого пузыря методом гибридизации in situ. 186
3.4. Исследования элементов генома клеточного происхождения 191
3.4.1. Идентификация аллелей PLA1 и PLA2 гена GP3a в генотипе пациентов 191
3.4.2. Первичный скрининг распределения генотипов гена GP3A среди пациентов с урогенитальными злокачественными опухолями 196
3.4.3. Анализ и оценка достоверности различий аллельного распределение гена GP3A у больных раком предстательной железы, группы контроля и в популяции 201
3.4.4. Анализ и оценка достоверности различий аллельного распределение гена GP3A у больных РПЖ в
зависимости от стадии заболевания 204
3.4.5. Анализ и оценка достоверности различий аллельного распределение гена GP3A у больных раком предстательной железы в зависимости от степени дифференцировки опухоли 207
3.4.6. Анализ и оценка достоверности различий аллельного распределение гена GP3 А у больных раком предстательной железы в зависимости от группы риска 212
3.5. Аллельное распределение гена GP3A в группах беременных женщин с гестозами и фетоплацентарной недостаточностью, контроля и в популяции . 216
3.5.1. Анализ распределения аллеля PLA2 в группах пациенток с разными сочетаниями диагнозов гестоза и/или патологии ФПС.
3.5.2. Анализ распределения аллелей PLA1 и PLA2 в разных группах беременных с гестозами и патологией ФПС. 220
3.5.3. Роль генотипов матери и плода в прогнозировании развития позднего гестоза и патологии фетоплацентарной системы 224
3.6. Исследование роли полиморфизма алкогольдегидрогеназы-2 в развитии алкогольной патологии в московской популяции 232
3.6.1. Анализ полиморфизма АДГ2 у лиц с алкогольной патологией 232
3.6.2. Роль полиморфизма АДГ2 в развитии алкогольного цирроза печени в зависимости от инфицирования вирусами гепатитов В и С. 236
Выводы. 247
Список литературы
