Введение
Глава 1.Обзор литературы 13
1.1. История и географическое распространение ЛЗН 13
1.1.1. Распространение и эпидемиологическая характеристика ВЗН на Африканском континент 13
1.1.2.Эпидемиологические особенности распространения ВЗН на территории США 15
1.1.3 .Проникновение вируса лихорадки Западного Нила в Европу и Россию 18
1.2. Таксономия и молекулярно-биологическая характеристика ВЗН 24
Глава 2. Материалы и методы 32
2.1. Методы эпидемиологического анализа 32
2.2. Штаммы вируса лихорадки Западного Нила, использованные в работе 33
2.3. Сбор, транспортировка, хранение и подготовка исследуемого материала 33
2.4. Молекулярно-биологические и иммунодиагностические методы 34
2.5. Компьютерный анализ секвенированных последовательностей 36
2.6. Используемые в работе компьютерные программы 36
Глава 3. Собственные исследования 38
3.1. Анализ вспышек лихорадки Западного Нила в Волгоградской области 38
3.1.1. Природно-климатические условия Волгоградского региона 38
3.1.2. Резервуар инфекции. Основные пути миграции 41
3.1.3 Основные переносчики ВЗН 49
3.1.4. Особенности клинического течения ЛЗН 51
3.1.5. Условия формирования природных очагов вируса ЛЗН 55
3.2. Пространственный эпидемиологический анализ территории Волгоградской области, отражающий степень риска заражением ЛЗН 75
3.3. Исследование полевого и клинического материала 83
3.3.1. Результаты исследования на наличие РНК ВЗН материала полученного от птиц 83
3.3.2. Данные мониторинга за возбудителем ЛЗН в основных переносчиках 83
3.3.3. Исследование клинического материала поступившего от больных, доноров и реконвалесцентов 84
3.4. Молекулярно-генетический анализ геномов ВЗН 87
3.4.1. Сравнительный анализ геномов с использованием специализированного программного обеспечения 88
3.4.2. Разработка олигонуклеотидных праймеров для идентификации всех генотипов ВЗН 94
3.4.3.Определение генотипической принадлежности вируса выделенного из анализируемых проб с использованием метода секвенирования 96
Заключение 99
Выводы 107
