Список используемых сокращений............................................................................... 4
Введение........................................................................................................................... 7
2. Литературный обзор ................................................................................................. 11
2.1. Краткая характеристика микроорганизма Acinetobacter baumannii. ............. 11
2.1.1. Капсульный полисахарид (КПС) A. baumannii. ......................................... 13
2.1.2. Липоолигосахарид A. baumannii.................................................................. 19
2.2. Общие сведения о бактериофагах ..................................................................... 23
2.2.1. Деполимеразы бактериофагов ..................................................................... 28
2.2.2. Применение бактериофагов ......................................................................... 31
Применение бактериофагов в животноводстве ................................................ 31
Использование бактериофагов в агрономии ..................................................... 34
Бактериофаги в пищевой промышленности...................................................... 37
Использование бактериофагов для лечения людей.......................................... 40
Бактериофаговая терапия, направленная на борьбу с A. baumannii. .............. 43
2.3. Заключение по литературному обзору.............................................................. 49
3. Результаты и их обсуждение.................................................................................... 51
3.1. Структурный анализ КПС.................................................................................. 51
3.2. Состав и строение КПС A. baumannii................................................................ 68
3.3. Структуры КПС A. baumannii ............................................................................ 77
3.3.1. КПС A. baumannii, содержащие нон-2-улозоновые кислоты .................... 77
КПС A. baumannii 52-249 (К218) ......................................................................... 80
КПС A. baumannii B11911 (К93).......................................................................... 91
КПС A. baumannii SGH0703 (K73) и UMB001 (K13) ........................................ 97
КПС A. baumannii BAL097 (К8) и RCH52 (К54).............................................. 104
КПС A. baumannii NIPH329 (K46)..................................................................... 110
КПС A. baumannii LUH5553 (К90) .................................................................... 113
КПС A. baumannii RES546 (К135) ..................................................................... 116
3.3.2. КПС A. baumannii, содержащие дезоксипиранозиды............................... 121
КПС A. baumannii SGH807 (К70) ...................................................................... 121
3
КПС A. baumannii RCH51 (К24) ........................................................................ 125
КПС A. baumannii BAL212 (К57)....................................................................... 128
КПС A. baumannii 46-1632 (К144) ..................................................................... 129
КПС A. baumannii KZ1098 (K26)....................................................................... 134
КПС A. baumannii 48-1789 (К106) и MAR24 (K112) ....................................... 138
КПС A. baumannii A388 (К20) и G21 (K21)...................................................... 143
КПС A. baumannii REV1184 (К98)..................................................................... 150
3.3.3. КПС A. baumannii, состоящие из гекса- и гексааминопиранозидов...... 155
3.4. Расщепление КПС с помощью фаговых и профаговых деполимераз......... 157
4.Экспериментальная часть........................................................................................ 177
4.1. Выделение КПС................................................................................................. 177
4.2. Гель-проникающая хроматография................................................................ 178
4.3. Определение состава КПС ............................................................................... 178
4.3.1. Анализ моносахаридов методом ГЖХ в виде ацетатов полиолов......... 178
4.3.2. Определение абсолютных конфигураций компонентов......................... 179
4.4. Модификация КПС .......................................................................................... 179
4.4.1. Мягкий кислотный гидролиз ..................................................................... 179
4.4.2. О-дезацетилирование................................................................................. 180
4.4.3. O-дезацеталирование .................................................................................. 180
4.4.4. Распад по Смиту.......................................................................................... 180
4.4.5. Сольволиз..................................................................................................... 180
4.5. Расщепление КПС рекомбинантными деполимеразами............................... 180
4.6. Масс-спектрометрия с ионизацией электрораспылением ............................ 181
4.7. Спектроскопия ЯМР ......................................................................................... 181
4.8. Биоинформатический анализ........................................................................... 182
Выводы......................................................................................................................... 183
Список литературы ..................................................................................................... 190
Приложение ................................................................................................................. 217
