Введение
ГЛАВА 1. Современное состояние, проблемы и возможности мрт-морфометрии в диагностике атрофических и очаговых изменений головного мозга 15
1.1. Методы автоматизированной постпроцессинговой обработки
МРТ изображений, используемые в морфометрическом анализе 15
1.1.1. Сегментация 15
1.1.2. Регистрация 20
1.1.3. Основные методы морфометрии головного мозга 22
1.1.4. Нормализация морфометрических данных 23
1.2. Атрофия вещества головного мозга при различных заболеваниях ЦНС 24
1.2.1. Атрофия вещества головного мозга при рассеянном склерозе 25
1.2.1.1. Клинически изолированный синдром 25
1.2.1.2. Рецидивирующе-ремиттирующий рассеянный склероз 27
1.2.1.3. Вторично-прогрессирующий рассеянный склероз 29
1.2.1.4. Первично-прогрессирующий рассеянный склероз 30
1.2.1.5. Региональная атрофия 31
1.2.1.6. Атрофия мозга как маркер инвалидизации 33
1.2.1.7. Атрофия мозга как маркер когнитивных нарушений 34
1.2.1.8. Прогноз для пациентов с клинически изолированным синдромом
и впервые выявленным рассеянным склерозом 36
1.2.2. Атрофия вещества головного мозга при ВИЧ-инфекции 36
1.3. Очаговое поражение головного мозга у пациентов с PC 41
ГЛАВА 2. Материалы и методы обследования 44
2.1. Общая характеристика обследованных пациентов 44
2.2. Клиническое обследование 47
2.3. Метод высокопольной магнитно-резонансной томографии 48
2.4. Метод позитронно-эмиссионной томографии
2.5. Методы статистического анализа результатов исследования 53
2.6. Методы постпроцессинговой обработки 53
2.6.1. Подготовка изображений к морфометрическому анализу структур головного мозга 54
2.6.1.1. Регистрация изображений 54
2.6.1.2. Использование нейроанатомических атласов для МРТ-морфометрии 56
2.6.2. Программы для удаления внемозговых структур и расчета внутричерепного объема 57
2.6.3. Программы для оценки общей и регионарной атрофии вещества головного мозга 59
2.6.3.1. AutoSeg 60
2.6.3.2. FSL 62
2.6.3.3. SIENAX 63
2.6.3.4. FreeSurfer 63
2.6.4. Методика сегментации очаговых изменений головного мозга 64
2.6.4.1. Подготовка исходных МРТ-данных для сегментации очагов 65
2.6.4.2. Мануальная сегментация 66
2.6.4.3. Автоматическая сегментация 66
2.6.4.3.1. Сегментация очагов с использованием атласов 67
2.6.4.3.2. Сегментация очагов с использованием машинного обучения 68
ГЛАВА 3. Сравнительные характеристики различных алгоритмов сегментации МРТ-изображений головного мозга 71
3.1. Сравнение алгоритмов удаления внемозговых структур 71
3.2. Сравнение алгоритмов сегментации структур для оценки общей атрофии вещества головного мозга 76
3.3. Сравнение алгоритмов сегментации структур для оценки регионарной атрофии вещества головного мозга 81
3.3.1. Сегментация подкорковых ядер головного мозга 82
3.3.2. Сегментация кортикального серого вещества головного мозга и измерение толщины коры 87
3.3.3. Сегментация белого вещества 89
3.4. Сравнение методов сегментации очагов .90
3.5. Общий алгоритм постпроцессинговой обработки МРТ-изображений 94
3.6. Влияние параметров МРТ-сканирования на результаты постпроцессинговой обработки 95
ГЛАВА 4. МРТ-морфометрия головного мозга у пациентов с рассеянным склерозом 99
4.1. Анализ общей атрофии 99
4.2. Анализ регионарной атрофии 104
4.3. Анализ очагового поражения 105
ГЛАВА 5. МРТ-морфометрия головного мозга у пациентов с ВИЧ-инфекцией 107
5.1. Изменения объемов базальных ядер головного мозга на ранних стадиях ВИЧ-инфекции 107
5.2. Регионарное изменение объема белого вещества головного мозга у пациентов на ранних стадиях ВИЧ-инфекции 111
5.3. Корреляция результатов МРТ-морфометрии с относительным уровнем регионарного метаболизма глюкозы по данным ПЭТ у пациентов на ранних стадиях ВИЧ-инфекции 114
ГЛАВА 6. Обсуждение полученных результатов 120
Выводы 133
Практические рекомендации 135
Список сокращений 137
Список литературы
