Введение
2. Развитие и современное состояние корреляционных подходов в изучении связи физико-химических свойств и биологической активности с молекулярной структурой органических соединений . 9
2.1. Теоретическое обоснование корреляционных подходов. 11
2.1.1. Энергия системы в простых квантовых подходах. 11
2.1.2. Линейные соотношения для свободной энергии в молекулярных процессах . 13
2.1.3. Термодинамические свойства. 14
2.1.4. Вид корреляционного соотношения. 15
2.2. Численное представление молекулярной
структуры 16
2.2.1. Топологические индексы. 17
2.2.2. Трехмерные дескрипторы молекулярной структуры. 20
2.2.3. Фрагментные и подструктурные дескрипторы молекулярной структуры. 21
2.2.4. Дескрипторы, описывающие структуру молекулы через другие свойства. Роль межмолекулярных взаимодействий. 23
3. Методы построения корреляционных моделей для оценок физико-химических свойств и биологической активности . 25
3.1. Фрагментное представление структуры молекул. 25
3.1.1. Разбиение молекулы на фрагменты. 25
3.1.2. Использование "реакции образования" для построения корреляционного соотношения. 29
3.1.3. Взаимодействие фрагментов. 33
3.1.4. Особенности корреляционного соотношения структура-свойство для гибких молекул. 34
3.2. Математические аспекты построения корреляционных моделей. 37
3.2.1. Использование ортогональных дескрипторов молекулярной структуры. 38
3.2.2. Отбор дескрипторов для корреляционных моделей. 39
3.2.3. Описательная и предсказательная сила моделей. 45
4. Расчет физико-химических свойств органических соединений разных классов . 49
4.1. Потенциальные функции и "прямые" методы расчета молекулярных свойств. 49
4.1.1. Расчет энергетических характеристик отдельных молекул и их комплексов в вакууме и водном окружении. 49
4.1.2. Использование метода RISM для расчета термодинамических характеристик гидратации
молекул насыщенных углеводородов. 55
4.2. Оценки физико-химических свойств органических соединений в корреляционных подходах . 59
4.2.1. Нормальные углеводороды. 59
4.2.2. Разветвленные насыщенные углеводороды. Роль многофрагментных вкладов. 64
4.2.3. Циклические, ненасыщенные и ароматические углеводороды и алифатические соединения, содержащие гетероатомы. 75
4.2.4. Насыщенные углеводороды, спирты и амины с разветвленными углеводородными радикалами. Альтернативное фрагментное представление молекулярной структуры. 82
4.2.5. Перфторуглероды. 92
4.3. Корреляционное соотношение структура-свойство для оценок log Р органических соединений разных классов. 103
4.3.1. Насыщенные углеводороды. 104
4.3.2. Гибкие молекулы углеводородов. 104
4.3.3. Циклические, ненасыщенные и ароматические углеводороды и алифатические соединения, содержащие гетероатомы. 112
4.3.4. Соединения с несколькими полярными группами. 119
4.3.5. Пептиды. 126
5. Оценки биологической активности в корреляционных подходах . 141
5.1. Модели взаимодействия рецептор - лиганд. 141
5.1.1. Комплексы "гость - хозяин" с участием а-циклодекстрина. 141
5.1.2. Корреляция структура - активность для некоторых ингибиторов нейраминидазы вируса гриппа . 153
5.2. Корреляционное соотношение для оценок лекарственного действия. 169
5.2.1. Расчет длительности действия барбитуратов. 169
5.2.2. Оценки периода полувыведения перфторуглеродов. 184
6. Заключение и выводы. 193
7. Литература.
