Введение
ГЛАВА 1. Система quorum sensing как новая перспективная мишень для антимикробной терапии (обзор литературы) 10
1.1. История открытия явления Quorum Sensing 10
1.2 Принцип организации систем Quorum Sensing 12
1.3 Биологическая роль систем Quorum Sensing 19
1.4 Особенности системы Quorum Sensing первого (LuxI-LuxR) типа 21
1.5 Система Quorum Sensing LuxI-LuxR типа у Chromobacterium violaceum 25
1.6 Методы и подходы к ингибированию системы Quorum Sensing
1.6.1 Ингибирование биосинтеза аутоиндуктора систем Quorum Sensing 28
1.6.2 Химическая или ферментативная деградация аутоиндуктора в среде обитания 31
1.6.3 Ингибирование связывания аутоиндуктора рецепторными белками 33
1.6.4 Блокирование экспрессии целевых генов 36
1.7 Растения и выделенные из них компоненты как ингибиторы систем Quorum Sensing патогенных бактерий 37
ГЛАВА 2. Материалы и методы исследования 46
2.1 Лекарственные растения и их экстракты 46
2.2 Методы разделения и анализа компонентного состава растительных экстрактов
2.2.1 Хроматографическое фракционирование экстракта коры дуба 49
2.2.2 Анализ компонентного состава коры дуба методом хромато-масс-спектрометрии
2.3 Библиотека химических соединений 51
2.4 Бактериальные штаммы и плазмиды
2.4.1 Виолацеинпродуцирующие штаммы Chromobacterium violaceum 51
2.4.2 Люминесцирующие штаммы Escherichia coli 54
2.5 Методы исследования анти-QS активности растительных экстрактов, их фракций и компонентов з
2.5.1 Исследование анти-QS активности в тестах ингибирования биосинтеза виолацеина 55
2.5.2 Исследование образования биопленки штаммами Chromobacterium violaceum 58
2.6 Оценка анти-QS активности растительных компонентов на биолюминесцентном штамме E. coli pAL103 59
2.7 Методы статистической обработки результатов исследования 60
Результаты и их обсуждение
Глава 3. Анализ биологической активности экстактов лекарственных растений в тестах на виолацеинпродуцирующих штаммах Chromobacterium violaceum 61
3.1 Скрининг экстрактов лекарственных растений в тесте ингибирования роста и пигмента виолацеина Chromobacterium violaceum 61
3.2 Анализ классификационного положения тестируемых лекарственных растений, проявляющих антибактериальную и анти-QS активности 68
3.3 Получение аддитивного биологического эффекта методом комбинирования активных QS-ингибирующих экстрактов 70
ГЛАВА 4. Исследование природы анти-qs активности экстракта коры дуба (quercus robur) 73
4.1. Хроматографическое исследование компонентного состава экстракта коры дуба (Quercus robur) 73
4.2. Анализ биологической активности ряда химических соединений, идентифицированных в составе экстракта коры дуба (Quercus robur) 81
4.3. Исследование биологических активностей производных 4-н-пропил-1,3-бензолдиола 86
4.4 Воссоздание молекулярной композиции экстракта коры дуба, сформированной из присутствующих в его составе малых молекул 94
Заключение 96
Выводы 104
Список сокращений 105
Список использованной литературы 106
