Введение
Глава 1. Обзор литературы. Пневмококковые инфекции. их особенности у детей, болеющих туберкулезом 14
1,1, Вторичные иммунодефициты и туберкулез как фактор риска развития тяжелых пневмококковых инфекций 15
1.2. Общая характеристика пневмококков. Факторы вирулентности 19
1.3. Носительство пневмококков 26
1.4. Неинвазивные пневмококковые инфекции 29
1.5. Инвазивные пневмококковые инфекции 30
1.6. Резистентность штаммов S. pneumoniae к антибактериальным химиопрепаратам 31
1.7. Иммунопрофилактика пневмококковых инфекций 37
1.8. Методы индикации пневмококков и их свойств 38
Глава 2. Материалы и методы исследования 41
2.1. Направления исследования 41
2.2. Материал и объект исследования 44
2.3. Методы исследования 46
2.3.1. Эпидемиологический метод 46
2.3.2. Микробиологические методы 46
2.3.3. Молекулярно-генетические методы 47
2.3.3.1. Идентификация штаммов пневмококка и изучение факторов вирулентности с помощью полимеразнои цепной реакции (ПЦР) 47
2.3.3.2. Изучение серотипового состава штаммов и факторов вирулентности пневмококков методом Multipex ПЦР 51
2.3.3.3. Изучение резистентности S. pneumoniae к антибиотикам методом ПЦР 53
2.3.3.4. Секвенирование 55
2.3.4. Статистические методы 56
Глава 3. Заболеваемость пневмококковыми инфекциями детей с туберкулезной инфекцией. Структура носительства условно-патогенных микроорганизмов верхних дыхательных путей 59
3.1. Изучение структуры и особенностей сопутствующей инфекционной заболеваемости пациентов специализированного стационара 59
3.2. Структура носительства условно-патогенных микроорганизмов верхних дыхательных путей у пациентов специализированного стационара 62
3.3. Структура носительства условно-патогенных микроорганизмов верхних дыхательных путей у медицинского персонала специализированного стационара 62
3.4. Структура носительства условно-патогенных микроорганизмов у пациентов соматического стационара 66
Глава 4. Серотиповая и генотиповая характеристика штаммов S. pneumoniae 70
4.1. Определение детерминант основных факторов вирулентности 71
4.2. Изучение серотипового состава штаммов S. pneumoniae с помощью ПЦР 73
4.3. Исследование комплекса факторов вирулентности штаммов S. pneumoniae 80
Глава 5. Мониторинг формирования антибиотикорезистентности штаммов S.pneumoniae 82
5.1. Чувствительность к антибиотикам штаммов S. pneumoniae 82
5.2. Изучение генетически обусловленной резистентности к антибиотикам штаммов S. pneumoniae 91
5.3. Распространение геновариантов резистентности к антибиотикам штаммов S. pneumoniae 98
Глава 6. Геноварианты штаммов S. pneumoniae по сочетанию генов, кодирующих факторы вирулентности, серотипового разнообразия и чувствительности к антимикробным препаратам 102
Заключение 112
Выводы 128
Рекомендации для внедрения в медицинскую науку и практическое здравоохранение 129
Список литературы 130
