Введение
Глава 1. Антибиотикорезистентность Neisseria gonorrhoeae: комплексный подход к проблеме (обзор литературы) 17
1.1. Возбудитель гонококковой инфекции 17
1.2. Современный подход к терапии гонококковой инфекции с учетом данных антибиотикорезистентности возбудителя 20
1.3. Механизмы формирования резистентности N. gonorrhoeae к цефалоспоринам III-го поколения 26
1.4. Современные методы типирования возбудителя гонококковой инфекции .37
1.5. Роль микробиологических методов в изучении чувствительности N. gonorrhoeae к антимикробным препаратам .44
1.6. Роль информационных технологий в сдерживании антибиотикорезистентности микроорганизмов .47
Глава 2. Материалы и методы исследования 52
2.1. Штаммы N. gonorrhoeae 52
2.2. Методология изучения чувствительности N. gonorrhoeae к антимикробным препаратам методом серийных разведений в агаре 53
2.3. Выделение бактериальной ДНК .56
2.4. Методология проведения полноразмерного секвенирования гена penA штаммов N. gonorrhoeae .56
2.5. Методология проведения молекулярного типирования методом NG-MAST 58
2.6. Методология проведения филогенетического анализа штаммов N. gonorrhoeae .61
2.7. Методология проведения математической обработки результатов исследований и разработки моделей прогнозирования распространения антибиотикорезистентных штаммов N. gonorrhoeae .62
Глава 3. Результаты изучения чувствительности штаммов N. gonorrhoeae, выделенных от больных гонококковой инфекцией, к антимикробным препаратам с использованием микробиологических методов 64
Глава 4. Результаты изучения взаимосвязи аминокислотных
замен в структуре пенициллинсвязывающего белка PBP2 N. gonorrhoeae с формированием механизмов развития устойчивости возбудителя к цефалоспоринам III-го поколения .75
Глава 5. Оценка генетического разнообразия штаммов N. gonorrhoeae на основании данных NG-MAST – типирования и филогенетического анализа 84
5.1. Результаты молекулярного типирования штаммов N. gonorrhoeae методом NG-MAST 85
5.2. Результаты филогенетического анализа штаммов N. gonorrhoeae, циркулирующих в Российской Федерации .93
Глава 6. Систематизация фено- и генотипических показателей чувствительности штаммов N. gonorrhoeae к антимикробным препаратам. 105
Глава 7. Результаты изучения взаимосвязи между молекулярными типами и показателями чувствительности штаммов N. gonorrhoeae к антимикробным препаратам с использованием математических методов анализа 110
Глава 8. Разработка математических моделей и компьютерной программы для анализа и прогноза распространения антибиотикорезистентных штаммов N. gonorrhoeae 124
8.1. Линейная модель (уравнение линейного тренда) .125
8.2. Линейная регрессионная модель 129
8.3. Компьютерная программа для анализа и прогноза распространения антибиотикорезистентных штаммов N. gonorrhoeae 135
8.4. Оценка качества прогноза распространения штаммов N. gonorrhoeae, нечувствительных к АМП, на территории Российской Федерации .143
Заключение .146
Выводы .159
Список сокращений .161
Список литературы
