Введение
ГЛАВА 1. Обзор литературы 19
1. 1 Этиология, заболеваемость и социальная значимость ГБМ 19
1. 2 Эпидемиологическая характеристика ГБМ различной этиологии 25
1. 3 Эпидемиологический надзор за ГБМ 29
1. 4 Молекулярно-биологический мониторинг возбудителей ГБМ 38
1. 5 Метод мультилокусного секвенирования-типирования в эпидемиологическом надзоре за возбудителями ГБМ 54
ГЛАВА 2. Материалы и методы 62
2. 1 Материалы исследования 62
2. 2 Лабораторные методы исследования 68
2. 3 Программное обеспечение и Интернет-ресурсы 76
2. 4 Базы данных для генотипирования возбудителей и эпидемиологического анализа 78
2. 5 Эпидемиологические методы 88
2. 6 Статистические методы 89
ГЛАВА 3. Разработка молекулярно-биологических методик для внутривидовой классификации возбудителей ГБМ 90
3. 1 Определение капсульных антигенов 91
3. 2 Методики, основанные на секвенировании 104
ГЛАВА 4. Результаты определения эпидемиологически значимых капсульных антигенов 108
4. 1 Серогруппы N. meningitidis 110
4. 2 Серотипы S. pneumoniae 115
ГЛАВА 5. Результаты генотипирования 121
5. 1 Характеристика N. meningitidis 122
5. 2 Генотипирование S. pneumoniae 141
5. 3 Генотипирование H. influenzae 148
ГЛАВА 6. Использование результатов генотипирования в эпидемиологическом надзоре за ГБМ 156
6. 1 Молекулярно-биологический мониторинг в эпидемиологическом надзоре за генерализованными формами менингококковой инфекции 156
6. 1. 1 N. meningitidis серогруппы А 158
6. 1. 2 N. meningitidis серогрупп B, С и W 172
6. 1. 3 Определение вариабельных фрагментов белков наружной мембраны N. meningitidis и его эпидемиологическое значение 189
6. 2 Молекулярно-биологический мониторинг в эпидемиологическом надзоре за ГБМ, вызванными S. pneumoniae 205
6. 3 Молекулярно-биологический мониторинг в эпидемиологическом надзоре за ГБМ, вызванными Hib 211
Заключение 228
Выводы 233
Практические рекомендации 236
Перспективы дальнейшей разработки темы 238
Список литературы 239
