Введение
Глава 1. Обзор литературы 10
1.1 Геном человека 10
1.2 Регуляция транскрипции генов 11
1.2.1 Регуляторные элементы генов 12
1.2.2 Регуляция транскрипции генов за счёт метилирования ДНК 18
1.2.3 Регуляция транскрипции генов за счёт модификаций хроматина 21
1.2.4 Роль клеточного протооикогена с-Мус в регуляции транскрипции генов 25
1.3 Некодирующие РНК 26
1.3.1 История обнаружения миРНК 28
1.3.2 Функции миРНК 31
1.3.3 Основные признаки мпРНК 31
1.4 РНК-маркёры опухолей 36
Глава 2. Материал и методы 41
Глава 3. Результаты 52
3.1 Результаты анализа структуры кластера Hs.633957 базы данных UniGene 52
3.2 Результаты экспериментальной проверка экспрессии локуса Hs.633957 в нормальных и опухолевых тканях 53
3.3 Определение первичной структуры транскриптов локуса Hs.633957 59
3.4 Определение основной сплайсинговой формы РНК 64
3.5 Анализ открытых рамок считывания 67
3.6 Анализ вторичной структуры РНК 68
3.7 Поиск потенциальных мишеней предсказанной миРНК 70
3.8 Изучение регуляторных участков локуса 71
3.9 Модификации хроматина в районе локуса Hs.633957 72
3.10 Связь хроматина в районе первого экзона локуса Hs.633957 с транскрипционными факторами 75
3.11 Идентификация сайтов связывания транскрипционного фактора с-Мус 79
3.12 Филогенетический анализ локуса Hs.633957 81
3.13 Поиск гомологичных транскрнптов 85
3.14 Происхождение повторов L2 и AluJo в локусе Hs.633957 85
3.15 Происхождение шпильки пре-миРНК Hs.633957 86
Глава 4. Обсуждение 91
4.1 Локус Hs.633957 транскрибируется с образованием различных форм транскрипта, но имеет одну доминирующую форму 91
4.2 В локусе Hs.633957 закодирована миРНК, потенциально способная регулировать экспрессию гена DPYS 92
4.3 Экспрессия локуса Hs.633957 обусловлена Мус-зависимым промотором, специфическим для приматов 94
4.4 Структурная и регуляторные области гена миРНК Hs.633957 произошли de novo у приматов 100
4.5 Последовательность Hs.633957 как онкомаркер 104
Заключение 107
Выводы 109
Благодарности 110
Список литературы 111
Приложения 129
