Введение
Глава 1. Обзор литературы 10.
1.1. Экология, эпидемиология и географическое распространение вируса Западного Нила 10.
1.2. Филогенетический анализ вируса Западного Нила, его происхождение и эволюция 18.
1.3. Генетическая организация и репликативный цикл флавивирусов 25.
1.4. Генетические факторы патогенности ВЗН 34.
Глава 2. Материалы и методы
2.1. Компьютерный анализ последовательностей ДНК 40.
2.2. Выделение РНК 40.
2.3. Реакция обратной транскрипции 41.
2.4. Проведение полимеразной цепной реакции 41.
2.5. Клонирование кДНК-фрагментов генома 41.
2.6. Приготовление компетентных клеток 42.
2.7. Трансформация плазмидной ДНК 42.
2.8. Электрофорез ДНК в агарозном геле 43.
2.9. Выделение фрагментов ДНК из агарозы 43.
2.10. Секвенирование ДНК 44.
2.11. Сайт-специфический мутагенез ДНК 44.
2.12. Транскрипция вирусной РНК in vitro 45.
Глава 3. Результаты.
3.1. Определение и анализ первичной структуры геномов 19-ти штаммов вируса Западного Нила, изолированных на территории Астраханской области в 2001-2005гг 46.
3.2. Клонирование полноразмерной кДНК-копии российского изолята вируса Западного Нила, относящегося к IV субтипу 67.
Глава 4. Обсуждение результатов 69.
Выводы 74.
Благодарности 74.
Список цитируемой литературы 75.
Приложение 86.
