СОДЕРЖАНИЕ
ВВЕДЕНИЕ ...................................................................................................................... 4
ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ .............................................................................. 11
1.1 Прогностические сывороточные биомаркеры .................................................. 12
1.2 Мутации отдельных генов в качестве прогностических и предикторных
маркеров рака почки .................................................................................................. 14
1.3 Опухолевая мутационная нагрузка (TMB) ....................................................... 15
1.4 Гистологические прогностические биомаркеры .............................................. 16
1.5 Предикторные биомаркеры ................................................................................ 17
1.6 Сигнатуры экспрессии отобранных панелей генов как прогностические и
предикторные биомаркеры…………………………………………………………18
1.7 PD-L1 как прогностический и предикторный биомаркер ............................... 23
1.8 МикроРНК и рак почки ....................................................................................... 24
1.8.1 Экспрессия микроРНК в опухолевой и здоровой ткани почки. .................. 25
1.8.2 МикроРНК как биомаркеры прогноза при раке почки……………………..26
1.8.3 МикроРНК как биомаркеры ответа на лечение ............................................. 29
1.8.4 Метилирование ДНК и ее значение для онкогенеза ..................................... 30
1.8.5 Роль метилирования генов микроРНК ........................................................... 31
1.8.6 Выбор белок-кодирующих генов и генов микроРНК для определения
уровня экспрессии…………………………………………………………………..32
Заключение ................................................................................................................. 35
ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ...................................................................... 36
2.1 Общая характеристика материала ...................................................................... 36
2.2 Характеристика клинического материала ......................................................... 37
2.3 Формирование выборки генов для исследования…………………………….38
2.4 Выделение высокомолекулярной ДНК ............................................................. 42
2.4.1 Выделение суммарной РНК. Проверка качества и измерение концентрации
РНК .............................................................................................................................. 43
2.4.2 Проведение реакции обратной транскрипции ............................................... 43
3
2.4.3 Полимеразная цепная реакция в реальном времени ..................................... 44
2.5 Анализ экспрессии генов .................................................................................... 44
2.6 Анализ метилирования генов микроРНК .......................................................... 45
2.7 Статистическая обработка данных .................................................................... 47
ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЯ .......................................................... 49
3.1 Анализ уровней экспрессии белок-кодирующих генов и уровня
метилирования генов микроРНК с развитием метастазов скПКР ........................ 49
3.2 Составление панели маркеров метастазирования ............................................ 51
3.3 Оценка прогностической значимости отобранных маркеров ......................... 54
3.4 Способ прогнозирования метастазирования скПКР ........................................ 56
ОБСУЖДЕНИЕ И ЗАКЛЮЧЕНИЕ ........................................................................... 63
ВЫВОДЫ ....................................................................................................................... 74
ПРАКТИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ ....................................................................... 75
СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ ........................................................................................... 76
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ ............................................................................................. 78
