Введение
Глава 1. Биоразнообразие сульфатвосстанавливающих бактерий в экстремальных местах обитания 9
1.1. Характеристика сульфатвосстанавливающих бактерий 9
1.1.1. Особенности конструктивного и энергетического обмена СВБ 10
1.1.2. Филогения сульфатвосстанавливающих прокариот 13
1.1.3. Экология и распространение сульфатвосстанавливающих бактерий 17
1.1.4. Методы детекции и анализа популяций сульфатредукторов 18
1.2. Распространение и активность сульфатвосстанавливающих бактерий в экосистемах содовых озер 21
1.3. Сульфатвосстанавливающие бактерии многолетнемерзлых отложений полярных областей 23
Глава 2. Алкалофильное микробное сообщество содовых озер 25
2.1. Содовые озера: происхождение и распространение 25
2.2. Содовые озера Забайкалья 26
2.3. Первичная продукция органического вещества в содовых озерах 28
2.4. Начальные этапы разложения органического вещества в содовых озерах 30
2.5. Терминальная стадия деструкции органического вещества 32
2.6. Микробное восстановление железа в содовых озерах 34
Заключение по обзору литературы 35
Глава 3. Материалы и методы исследования 37
3.1 Районы и объекты исследования 37
3.2. Среды и условия культивирования 39
3.3. Микробиологические методы учета численности бактерий 41
3.4. Методы контроля чистоты культур 43
3.5. Микроскопические методы исследования 43
3.6. Изучение физиолого-биохимических свойств изолятов 43
3.7. Спорообразование 45
3.8. Аналитические методы 45
3.8.1. Определение продуктов брожения и окисления 45
3.8.2. Определение сероводорода 46
3.8.3. Определение десульфовиридина, цитохромов и менахинонов 46
3.8.4. Определение ионов двухвалентного железа 47
3.8.5. Анализ жирнокислотного состава клеток 47
3.9. Молекулярно-генетические методы 48
3.9.1. Выделение хромосомной ДНК 48
3.9.2. Определение содержания Г+Ц пар в ДНК 49
3.9.3. ДНК-ДНК гибридизация 50
3.9.4. Разработка праймеров in silico 50
3.9.5. Полимеразная цепная реакция 50
3.9.6. Секвенирование 52
3.9.7. Филогенетический анализ 52
Глава 4. Результаты и обсуждение 53
4.1. Определение численности бактерий в криопэгах полуострова Ямал 53
4.2. Психротолерантный сульфатредуктор из арктического криопэга 55
4.3. Обнаружение сульфатвосстанавливающих бактерий в содовых озерах Соленое и Сульфатное 59
4.4. Определение численности сульфатредукторов в содовых озерах 62
4.5. Новые анаэробные бактерии содовых озер 64
4.5.1. Сульфатвосстанавливающие бактерии 64
4.5.2. Выделение и характеристика анаэробной алкалофильной протеолитической бактерии 71
4.6. Восстановление Fe(III) сульфатвосстанавливающими бактериями в щелочных условиях 78
4.7. Новые виды анаэробных бактерий 79
Заключение 82
Выводы 84
Список сокращений 85
Список литературы
