ВВЕДЕНИЕ .................................................................................................................... 4
Глава 1. СОВРЕМЕННЫЕ ПРЕДСТАВЛЕНИЯ О НЕКОТОРЫХ МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИХ ОСОБЕННОСТЯХ РАКА ЛЕГКОГО (обзор литературы)................................................................................................ 12
1.1 Современные тенденции в заболеваемости и смертности от рака легкого .......................................................................................................... 12
1.2 Паттерны соматических аберраций гена EGFR при немелкоклеточном раке легкого и в других типах опухолей ................. 18
1.2.1 Роль EGFR в метаболизме раковых клеток ......................................... 20
1.2.2 Соматические мутации в гене EGFR у больных раком легкого ....... 21
1.3 Мутации в гене BRAF: роль в онкогенезе и лечении рака легкого ....... 26
1.3.1 Химиотерапия ......................................................................................... 28
1.3.2 Ингибиторы контрольных точек иммунитета .................................... 28
1.3.3 Таргетная терапия .................................................................................. 29
1.4 Роль гена PIK3CA для активации PI3K/Akt/mTOR пути при раке легкого .......................................................................................................... 30
1.5 Сопутствующие генетические изменения и их влияние на клинические показатели у пациентов с немелкоклеточным раком легкого .......................................................................................................... 35
Глава 2. МАТЕРИАЛ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ. ........................................... 40
2.1 Характеристика этапов исследования ...................................................... 40
2.2 Методики молекулярно-генетического исследования ............................ 48
2.2.1 Выделение геномной ДНК из парафиновых блоков набором «ДНК-сорб-В» (AmpliSens) ....................................................................... 48
2.2.2 Измерение концентрации ДНК............................................................. 50
2.2.3 Методика определения мутаций в гене EGFR .................................... 50
2.2.4 Методика определения мутаций в гене BRAF .................................... 50
2.2.5 Методика определения мутаций в гене PIK3CA ................................ 50
2.2.6 Определение относительной копийности генов методом RT-qPCR ............................................................................................................. 52
3
2.2.7 Методика определения перестроек генов ALK и ROS1 ..................... 55
2.3 Статистические методы обработки данных ............................................. 55
Глава 3. КЛИНИЧЕСКАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА ПАЦИЕНТОВ КРЫМСКОЙ ПОПУЛЯЦИИ С НЕМЕЛКОКЛЕТОЧНЫМ РАКОМ ЛЕГКОГО, ПОЛУЧАВШИХ ЛЕЧЕНИЕ В 2014-2017 гг. .................................................... 57
Глава 4. СРАВНИТЕЛЬНАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА СОМАТИЧЕСКИХ МУТАЦИЙ У ПАЦИЕНТОВ С НЕМЕЛКОКЛЕТОЧНЫМ РАКОМ ЛЕГКОГО ............................................................................................................ 67
4.1 Сравнительная характеристика соматических мутаций в гене EGFR у пациентов с немелкоклеточным раком легкого .................................... 67
4.2 Определение соматических мутаций в гене BRAF и транслокаций с участием генов ALK, ROS1 у пациентов с немелкоклеточным раком легкого .......................................................................................................... 72
4.3 Сравнительная характеристика соматических мутаций в гене PIK3CA у пациентов с немелкоклеточным раком легкого ..................... 76
Глава 5. ИССЛЕДОВАНИЕ КОПИЙНОСТИ 14-ТИ ГЕНОВ В ОБРАЗЦАХ НЕМЕЛКОКЛЕТОЧНОГО РАКА ЛЕГКОГО ................................................. 80
ЗАКЛЮЧЕНИЕ ............................................................................................................. 87
ВЫВОДЫ ....................................................................................................................... 93
ПРАКТИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ ....................................................................... 94
СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ ........................................................................................... 95
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ ............................................................................................. 97
