Введение
ГЛАВА 1 Внутрибольничный инвазивный кандидоз - проблемы современной лабораторной диагностики (Обзор литературы) .10
1.1 Краткая историческая справка .10
1.2 Грибы рода Candida –возбудители инвазивного кандидоза 14
1.3 Современные подходы к видовой идентификации возбудителей инвазивного кандидоза .21
1.4 Чувствительность возбудителей инвазивного кандидоза к противогрибковым препаратам 31
1.5 Современные методы определения чувствительности Candida spp. к противогрибковым препаратам .35
ГЛАВА 2 Материалы и методы исследования 43
2.1 Объекты исследования 43
2.2 Подготовка культур Candida spp. 43
2.3 Идентификация Candida spp. методом ДНК – секвенирования .44
2.4 Идентификация Candida spp. методом MALDIOF масс-спектрометрии 46 2.4.1 Изучение комплекса видов C. parapsilosis .48
2.5 Видовая идентификация возбудителей внутрибольничного инвазивного кандидоза с помощью тест-системы AUXACOLOR2 49
2.6 Изучение морфологических особенностей возбудителей инвазивного кандидоз .49
2.7 Методы определения чувствительности Candida spp. к противогрибковым препаратам in vitro 2.7.1 Метод микроразведений в жидкой питательной среде - CLSI M27-A3 .51
2.7.2 Диско-диффузионный метод определения чувствительности - CLSI M44-А 54
2.7.3 Определение чувствительности с помощью микробиологического анализатора Vitek 2 Compact .55
2.8 Статистическая обработка результатов 55
Результаты собственного исследования
ГЛАВА 3 Определение видового спектра клинических изолятов Candida spp 56
3.1 Источники выделения возбудителей инвазивного кандидоза 56
3.2 Сравнение результатов видовой идентификации Candida spp. методами ДНК-секвенирования и MALDIOF масс-спектрометрии 57
3.3 Сравнение результатов видовой идентификации штаммов Candida spp. методами MALDIOF масс-спектрометрии и тест-системой AUXACOLOR 2 59
3.4 Видовой спектр возбудителей внутрибольничного инвазивного кандидоза в течение 2012-2014 гг .66
3.5 Географические особенности этиологии инвазивного кандидоза .69
3.6 Морфологические особенности возбудителей инвазивного кандидоза...71
3.7 Протеомное профилирование возбудителей инвазивного кандидоза 81
3.8 Молекулярно-генетические особенности возбудителей инвазивного кандидоза 83
ГЛАВА 4 Определение чувствительности клинических изолятов Candida spp. к противогрибковым препаратам 89
4.1 Результаты определения чувствительности возбудителей инвазивного кандидоза методом CLSI M27-A3 89
4.1.1 МПК противогрибковых препаратов для различных видов Candida spp .92
4.2 Результаты определения чувствительности возбудителей инвазивного кандидоза методом CLSI M44-А 99
4.3 Результаты определения чувствительности возбудителей инвазивного кандидоза с помощью анализатора Vitek2 Compact 102
ГЛАВА 5 Заключение 108
Выводы 119
Практические рекомендации .121 перспективы разработки темы 122
Список условных сокращений 123
Список литературы .
