Введение
Глава 1. Обзор литературы 16
1.1 Методы исследования в ранней диагностике первичной открытоугольной глаукомы 18
1.2 Возможности использования протеомного анализа в исследовании биологических жидкостей 24
1.3 Современные представления о слезной жидкости 27
1.4 Современные представления о жидкости передней камеры глаза 28
1.5 Возможности протеомного анализа слезы и жидкости передней камеры глаза в диагностике офтальмопатологии 29
1.5.1 Белки, выявленные при протеомном анализе слезы, жидкости передней камеры глаза и плазмы крови 29
1.5.2 Результаты протеомного анализа при офтальмопатологии 35
1.6 Возможности протеомного анализа слезы и жидкости передней камеры глаза в диагностике первичной открытоугольной глаукомы 38
Глава 2. Материал и методы исследования 41
2.1 Характеристика клинического материала 41
2.2 Клинико-функциональные методы исследования 43
2.3 Методы получения биоматериалов для биохимических исследований 44
2.3.1 Забор слезной жидкости 44
2.3.2 Забор жидкости передней камеры глаза 45
2.4 Методы протеомного изучения жидкости передней камеры глаза 46
2.4.1 Методы пробоподготовки 46
2.4.2 Методы протеомного анализа 53
2.5 Методы биоинформационного анализа и статистическая обработка данных 55
2.5.1 Обработка данных в программе MaxQuant 55
2.5.2 Обработка данных в программе Perseus 55
2.5.3 Анализ аннотации белков жидкости передней камеры глаза элементами Gene Ontology 56
2.5.4 Статистический анализ 57
2.6 Методы изучения белков слезной жидкости 58
2.6.1 Иммуноблоттинг на сухой мембране 58
2.6.2 «Классический» Вестерн-блоттинг 59
Глава 3. Результаты исследования и их обсуждение 63
3.1 Белки жидкости передней камеры глаза, полученные в результате протеомного анализа, и их функции 63
3.2 Состав протеома жидкости передней камеры глаза 64
3.3 Распределение белков жидкости передней камеры глаза в выделенных клинических подгруппах 67
3.4 Характеристика белков жидкости передней камеры глаза, выделенных только в подгруппе «катаракта + первичная открытоугольная глаукома» 83
3.5 Характеристика белков жидкости передней камеры глаза, выделенных в подгруппах «катаракта» и «катаракта + псевдоэксфолиативный синдром» 87
3.6 Аполипопротеин D – потенциальный биомаркер псевдоэксфолиативного синдрома 88
3.7 Сравнение полученного протеома жидкости передней камеры глаза с другими базами данных 90
3.8 Результаты анализа слезной жидкости 122
Заключение 124
Выводы 129
Практические рекомендации 130
Список литературы 131
