Введение
Глава 1. Обзор литературы 22
Глава 2. Адаптивный ландшафт одиночных аминокислотных сайтов 33
2.1. Положительный отбор в прошлом и отрицательный отбор в настоящем 33
2.2. Положительный отбор в эволюции консервативных сегментов белков 46
2.3. Падение приспособленности потерянных аминокислот 60
Глава 3. Эпистатический адаптивный ландшафт пар аминокислотных сайтов 67
3.1. Асимметрия аминокислотных различий, накопленных высокоизменчивой популяцией 67
3.2. Приспособление генов вируса гриппа к радикальному изменению генетического окружения 74
3.3. Скоординированная эволюция поверхностных белков вируса гриппа 93
Глава 4. Эпистатический отбор на концах кодирующей части гена 122
4.1. Эпистаз между альтернативными сайтами инициации трансляции в геномах эукариот 122
4.2. Эпистатическая эволюция длины генов у прокариот 144
Заключение 158
Список публикаций по теме диссертации 163
Список литературы 166
Список сокращений 198
