Введение
ГЛАВА 1. Обзор литературы 16
1.1. Клинические характеристики нейробластомы 16
1.2. Стратификация больных нейробластомой на группы риска 17
1.3. Молекулярно-генетические факторы, не включенные в схемы стратификации 29
1.4. Молекулярно-генетические методы, используемые для идентификации прогностических биологических маркеров 33
1.5. Выявление поражения КМ и оценка минимальной остаточной болезни при нейробластоме 35
1.6. Прогностическое значение выявления инициального поражения КМ и мониторинга минимальной остаточной болезни... 41
ГЛАВА 2. Материалы и методы исследования 45
2.1. Характеристика пациентов, включенных в исследование 45
2.2. Исследование генетических аберраций, ассоциированных с изменением количества копий генов или хромосомных регионов... 46
2.3. Исследование прогностической значимости генетических аберраций, ассоциированных с изменением количества копий генов или хромосомных регионов 57
2.4. Исследование инициального поражения КМ и оценка МОБ на основании экспрессии опухоль-ассоциированных генов 58
2.5. Сравнение применения ПЦР-РВ и проточной цитометрии для выявления поражения КМ и оценки МОБ 61
2.6. Исследование поражения КМ и оценка МОБ с помощью молекулярного маркера, основанного на анализе метилирования геномной ДНК з
2.7. Исследование прогностической значимости инициального поражения КМ и оценки МОБ у больных нейробластомой 64
2.8. Качественная и количественная оценка РНК, используемой для выявления поражения КМ и оценки МОБ 66
2.9. Статистическая обработка данных 71
ГЛАВА 3. Исследование генетических аберраций, ассоциированных с изменением количества копий генов или хромосомных регионов 72
3.1. Результаты определения количества копий гена MYCNn аберраций короткого плеча хромосомы 2 72
3.2. Результаты определения аберраций короткого плеча хромосомы 1 83
3.3. Результаты определения аберраций короткого плеча хромосомы 3 92
3.4. Результаты определения аберраций хромосомы 4 96
3.5. Результаты определения аберраций хромосомы 7 100
3.6. Результаты определения аберраций короткого плеча хромосомы 9 105
3.7. Результаты определения аберраций хромосомы 11 112
3.8. Результаты определения аберраций хромосомы 12 119
3.9. Результаты определения аберраций хромосомы 14 124
3.10. Результаты определения аберраций хромосомы 17 129
3.11. Результаты определения генетических аберраций в парах первичная опухоль-рецидив (прогрессия) 137
ГЛАВА 4. Исследование молекулярно-генетических маркеров для выявления инициального поражения костного мозга и оценки минимальной остаточной болезни 140
4.1. Исследование инициального поражения КМ и оценка МОБ на основании экспрессии опухоль-ассоциированных генов 140
4.2. Прогностическое значение выявления поражения КМ и МОБ на основании экспрессии опухоль-ассоциированных генов 151
4.3. Выявление контаминации препаратов АГСК и МОБ на момент проведения лейкафереза на основании экспрессии опухоль-ассоциированных генов 157
4.4. Сравнение результатов выявления поражения КМ при помощи экспрессии опухоль-ассоциированных генов и проточной цитометрии 159
4.5. Исследование поражения КМ и оценка МОБ на основании выявления метилированной формы гена RASSFla и определение
его прогностической значимости 162
4.6. Сопоставление результатов выявления поражения КМ с помощью метилированной формы гена RASSFla с определением экспрессии опухоль-ассоциированных генов и проточной цитометрией 165
Заключение 170
Выводы 180
Практические рекомендации 182
Перспективы дальнейшей разработки темы 182
Список литературы 1
