Введение
Глава 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
1.1. Характеристика озера Байкал 8
1.2. Экологические факторы, определяющие развитие микроорганизмов в определенных районах озера
1.3. Физико-химическая характеристика донных осадков озера Байкал и поровых вод
1.4. Органическое вещество донных осадков озера Байкал 17
1.5. История микробиологических исследований донных осадков озера Байкал
1.6. Численность микроорганизмов донных осадков озера Байкал 21
1.7. Разнообразие микроорганизмов донных осадков озера Байкал 24
1.8. Исследование структуры микробных сообществ методами молекулярной биологии
1.9. Биоразнообразие бесцветных серных бактерий 27
Глава 2. ОБЪЕКТЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЙ
2.1. Объекты исследования и методы отбора проб 31
2.2. Методы выделения суммарной бактериальной ДНК 35
2.3. Методы молекулярной микробиологии 36
Глава 3. РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЯ И ИХ ОБСУЖДЕНИЕ
3.1. Сравнение стратегий методов выделения суммарной бактериальной ДНК из донных осадков озера Байкал 47
3.2. Анализ таксономического состава поверхностных и глубинных слоев донных осадков Посольской банки
3.2.1. Филогенетическое разнообразие микроорганизмов поверхностного слоя осадков станции Посольская банка
3.2.2. Филогенетическое разнообразие микроорганизмов глубинного слоя осадков станции Посольская банка
3.3. Исследование микробного сообщества бесцветных серных бактерий
3.3.1. Распространение и морфология бесцветных серобактерий 80
3.3.2. Филогенетическое положение байкальской бактерии рода Thioploca
3.3.3. Сопутствующее микробное сообщество бактерии рода Thioploca
3.3.4. Филогенетическое положение серной бактерии рода Thiothrix 103
ЗАКЛЮЧЕНИЕ 106
ВЫВОДЫ 109
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ 111
ПРИЛОЖЕНИЯ 131
