Введение
Глава 1. Состояние и основные тенденции крупных многоаспектных баз данных (БД) в области химии 13
1.1. Проектирование и разработка крупных БД в области химии 13
1.1.1 Современные крупные БД в области химии 13
1.1.2 Основные задачи БД в области химии 20
1.1.3 Разработка БД для информационных систем (ИС) в области химии 22
1.1.4 Обзор инструментальных средств разработки БД 26
1.2 Форматы представления химической информации 32
1.3 Подходы к решению основных задач крупных БД в области химии 39
1.3.1 Поиск/идентификация химических веществ 39
1.3.2 Использование дескрипторов химических веществ 43
1.3.3 Регистрация химических веществ в современных крупных БД 45
1.3.4 Классификация химических веществ в современных крупных БД 47
1.3.5 Синтез информации в БД 48
1.4 Применение формул Маркуша в химических БД 54
1.4.1 Родовые химические структуры (формулы Маркуша) 54
1.4.2 Применение формул Маркуша в патентных БД 55
Глава 2. Программно-технологические решения регистрации и классификации химико-структурных данных для фактографической базы данных (БД) на основе применения формул Маркуша 61
2.1 Задача разработки программно-технологических средств для регистрации и классификации химико-структурных данных в химической БД 61
2.2 Программно-технологические решения для загрузки данных в БД. 63
2.3 Программно-технологические решения для идентификации/регистрации химических веществ 64
2.4 Программно - технологические решения для поиска химических веществ 66
2.5 Программно-технологические решения применения формул Маркуша 69
2.5.1 Язык описания Маркуш -радикалов 70
2.5.2 Интеграция в БД редактора MSE (Molecular Structure Editor) 71
2.5.3 Подсистема хранения формул Маркуша 73
2.5.4 Подсистема поиска по формулам Маркуша 73
2.6 Использование молекулярных фрагментов (структурных дескрипторов) химических веществ 75
2.7 Программно-технологические решения для классификации информации 76
2.7.1 Программно-технологические решения для классификации информации на основе справочников -реестров 76
2.7.2 Программно-технологические решения для классификации информации на основе количественных данных 77
2.7.3 Программно-технологические решения для классификации информации на основе молекулярной информации (дескрипторы, структуры, формулы Маркуша) 77
2.7.4 Программно-технологические решения для классификации информации на основе статистических моделей 79
Глава 3. Методы, алгоритмы и программные средства для классификации и синтеза информации 82
3.1 Методологические подходы моделирования, классификации и синтеза информации 82
3.2 Информационная классификация 83
3.3 Статистическая байесовская классификация 84
3.4 Примеры использования байесовского подхода к классификации химических веществ 88
3.5 Статистическая количественная классификация 92
Глава 4. Основные фрагменты структуры данных БД 95
4.1 Концептуальная (логическая) схема БД 95
4.2 Основные фрагменты физической структуры данных для регистрации/хранения химических веществ в БД 96
4.3 Основные фрагменты физической структуры данных для классификации химических веществ в БД 99
4.4 Основные фрагменты физической структуры данных для хранения фактографической информации в БД 101
4.5 Основные фрагменты физической структуры данных для регистрации хранения химических структур и молекулярных дескрипторов в БД 105
Глава 5. Основные формы пользовательского интерфейса БД 108
5.1 Экранная форма «Химикат» 108
5.2 Экранная форма «Поиск химикатов по структурной составляющей» 113
5.3 Экранная форма «Дескрипторы» 116
5.4 Экранная форма для классификации «Категорированные данные» 117
5.5 Экранная форма «Количественные данные» 122
5.6 Экранная форма «Обобщенный поиск» 126
5.7 Экранная форма «Обобщенный фильтр» 128
5.8 Экранная форма «Регрессионное моделирование» 130
5.9 Байесовский прогнозатор 134
5.9.1 Экранная форма «Байесовский прогнозатор» 135
5.9.2 Экранная форма «Отбор дескрипторов» 137
5.9.3 Экранная форма «Построение моделей RTECS» 139
5.9.4 Экранная форма «Построение моделей TOXIC» 140
5.9.5 Экранная форма «Прогноз» 142
Направления дальнейших применений 146
Заключение 147
Литература
