Введение
Глава 1. Обзор литературы 9
1.1. Механизм убиквитилирования 9
1.2. Общая характеристика ЕЗ убиквитин-протеин лигаз. НЕСТ-доменные убиквитин-протеин лигазы
1.2.1. Структурно-функциональная характеристика группы С2- WW-HECT убиквитин-протеин лигаз
1.2.2. Структурно-функциональная характеристика подгруппы HERC белков
1.3. Роль НЕСТ-доменных убиквитин-протеин лигаз в развитии патологических состояний
1.4. Биоинформатика как самостоятельная область исследований
Глава 2. Материалы и методы 34
2.1. Общая часть 3 4
2.2. Формирование выборки белков 36
2.3. Алгоритм поиска гомологов 48
2.4. Парное выравнивание аминокислотных последовательностей
2.5. Множественное выравнивание аминокислотных последовательностей
2.6. Филогенетический анализ 49
2.7. Доменный анализ белков 49
2.8. Анализ профилей экспрессии белков 50
Глава 3. Результаты и их обсуждение 51
3.1. Филогенетический анализ НЕСТ-доменных убиквитин- протеин лигаз
3.2. Анализ доменной организации НЕСТ-доменных убиквитин-протеин лигаз
3. Формирование классификации НЕСТ-доменных убиквитин-протеин лигаз
4. Анализ профилей экспрессии НЕСТ-доменных убиквитин- протеин лигаз
Выводы 106
Список литературы 107
Приложение 129
