Введение
ГЛАВА 1. Обзор литературы 14
1.1 Традиционные методы анализа кривых рентгеновского малоуглового рассеяния 14
1.1.1 Определение структурных инвариантов 18
1.1.2 Расчет структурных характеристик сильно вытянутых частиц 21
1.2 Информационное содержание данных малоуглового рассеяния... 25
1.3 Методы восстановления формы частиц при отсутствии дополнительной информации 26
1.4 Расчет кривых малоуглового рассеяния частицами с известной кристаллографической структурой 34
1.5 Анализ структуры белков и комплексов. Метод молекулярной тектоники 37
1.6 Кривые малоуглового рассеяния смесями: исследование формы и количества компонент 39
1.7 Новые задачи рентгеновского малоуглового рассеяния 40
ГЛАВА 2. Получение, обработка и интерпретация данных рентгеновского малоуглового рассеяния 43
2.1 Сбор данных синхротронного рассеяния: установка ХЗЗ кольца DORIS III (DESY) 43
2.2 Первичная обработка данных 48
2.3 Анализ и интерпретация данных. Программа PRIMUS. Система ATS AS 2.0 50
ГЛАВА 3. База данных для быстрой классификации белков но данным рентгеновского малоуглового рассеяния 58
3.1 Атомные модели и критерии сравнения кривых 59
3.2 Малоугловая часть мапоугловых данных и аналоги по внешней форме 63
3.3 Сред неугловая часть кривой и аналоги по доменной архитектуре 66
3.4 Алгоритм и пользовательский интерфейс разработанной базы данных » DaRa 69
3.5 Примеры использования базы данных 73
ГЛАВА 4. Определение структуры вертексного комплекса бактериофага PRD1 в растворе 79
4.1 Бактериофаг PRDI как структурный аналог аденовируса 79
4.2 Экспериментальные данные 84
4.3 Учет дополнительной информации 85
4.4 Построение моделей 87
ГЛАВА 5. Исследование процесса олигомеризации промежуточного филамента виментина в различных внешних условиях 100
5.1 Промежуточные филаменты: компонента цитоскелета 100
5.2 Экспериментальные данные и алгоритм их обработки 106
5.3 Построение моделей олигомеров виментина 110
5.4 Олигомеризация виментина в различных внешних условиях 117
Заключение 130
Библиография 135
