Введение
Глава 1. Обзор литературы 8
1.1 Критерии выделения таксонов и их делимитации 8
1.2 Филогенетический подход к систематике 13
1.3 Влияние восприятия скоростей эволюции последовательностей ДНК на делимитацию таксонов 15
1.4 Построение филогении и делимитация таксонов с использованием данных мультигенного анализа 19
1.5 Критерии надёжности реконструкций филогении 21
1.6 Состояние системы Onuphidae на момент начала исследований 23
1.7 Состояние системы рода Nannopus до оценки родства морф и популяций. 25
1.8 Состояние системы Portunoidea до начала исследований 26
Глава 2 Материал и методы 28
2.1 Выбор групп 28
2.2 Материал 29
Оригинальные данные 29
Сторонние данные 33
2.3 Методы 34
Выделение ДНК 34
Амплификация и секвенирование 39
Множественное выравнивание 43
Методы реконструкции филогенетических отношений 43
Глава 3. Результаты 44
3.1 Реконструкция филогенетических отношений в группе Onuphidae 44
3.2 Скрытая изменчивость «вида» Nannopus palustris 51
3.3 Реконструкция филогенетических отношений в группе крабов Portunoidea 59
Глава 4. Обсуждение 69
4.1. Обнаружение скрытого разнообразия внутри таксонов 69
4.2. Подтверждение существующей таксономии 71
4.2.1 Подтверждение существующей таксономии для Onuphidae 71
4.2.2 Подтверждение существующей таксономии для Portunidae 73
4.3. Таксономические ревизии, необходимые согласно наблюдаемой по молекулярным данными филогении 75
4.3.1. Необходимость ревизии Onuphidae 75
4.3.2. Необходимость выделения новых таксонов из состава Nannopus palustris 76
4.3.3. Необходимость ревизии Portunoidea 77
4.4. Валидация используемых в таксономии морфологических признаков 80
4.4.1 Валидация используемых в таксономии Onuphidae признаков 80
4.4.2 Высокий уровень морфологической пластичности Nannopus palustris. 81
4.4.3 Валидация используемых в таксономии Portunoidea признаков 82
Глава 5. Заключение 84
Выводы 88
Библиография 89
