Введение
I Обзор литературы 16
1.1 Факторные инфекции животных: этиология и патогенез 16
1.2 Факторы персистенции микроорганизмов 23
1.3 Прикладные аспекты использования факторов персистенции микроорганизмов 35
II Собственные исследования 43
2.1 Материалы и методы исследований 43
2.1.1 Характеристика культур микроорганизмов 43
2.1.2 Отбор проб, выделение и идентификация микроорганизмов 46
2.1.3 Методы изучения биологических свойств микроорганизмов 53
2.1.3.1Определение факторов персистенции микроорганизмов 53
2.1.3.2 Определение антибиотикочувствительности микроорганизмов 60
2.1.4 Определение генетических детерминант бактериоциногении и вирулентности энтерококков 61
2.1.5 Полногеномное секвенирование фекального изолята Enterococcus faecium ICIS 96 64
2.1.6 Методы изучения регулирующего влияния биологически-активных веществ на персистентный потенциал микроорганизмов 65
2.1.6.1 Оценка антибактериальной активности антимикробных пептидов из тромбоцитов 65
2.1.6.2 Флуоресцентная микроскопия и спектроскопия в оценке биологического действия антимикробных пептидов 66
2.1.6.3 Методика изучения влияния АМП из тромбоцитов кур на перси-стентные свойства микроорганизмов 66
2.1.6.4 Методика изучения влияния синтетического производного индоли-цидина на факторы персистенции микроорганизмов 67
2.1.6.5 Методика изучения влияния фитосубстанций на персистентные свойства микроорганизмов 68
2.1.6.6 Определение антиоксидантной активности фитосубстанций 69
2.1.7 Методы изучения межмикробных взаимодействий 70
2.1.7.1 Методика совместного культивирования грибов рода Malassezia и бактерий рода Staphylococcus 70
2.1.7.2 Методика совместного культивирования грибов рода Candida и бактерий рода Enterococcus 70
2.1.8 Методы статистической обработки полученных результатов 71
2.2 Видовой состав микроорганизмов, выделенных от животных с факторными заболеваниями 72
2.2.1 Видовой состав микроорганизмов, выделенных от собак с наружными отитами 72
2.2.2 Видовое разнообразие микроорганизмов, выделенных при гнойно воспалительных заболеваниях собак (пиометра, конъюнктивит) 80
2.2.3 Видовой состав микроорганизмов, выделенных из секрета молочных желз коров 82
2.2.4 Видовой состав энтерококков, выделенных от здоровых животных и животных с инфекционно-воспалительными заболеваниями 84
2.2.5 Видовой состав грибов рода Candida, выделенных от цыплят бройлеров 86
2.3 Характеристика биологических свойств условно-патогенных микроорганизмов, выделенных от животных с факторными заболеваниями 88
2.3.1 Биологические свойства условно-патогенных микроорганизмов, выделенных от собак с отитами 88
2.3.1.1 Факторы персистенции условно-патогенных микроорганизмов, выделенных от собак с отитами 88
2.3.1.2 Разработка программы для прогнозирования развития хронического наружного отита у собак 100
2.3.1.3 Резистентность условно-патогенных микроорганизмов, выделенных при отитах, к антибактериальным и антигрибковым препаратам 104
2.3.2 Биологические свойства бактерий, выделенных от собак с пиометрой и конъюнктивитом 112
2.3.3 Биологические свойства условно-патогенных микроорганизмов, изолированных из молока у здоровых коров и при разных формах мастита 117
2.3.3.1 Характеристика персистентного потенциала бактерий, выделенных из молока здоровых коров и секрета молочной железы при мастите 117
2.3.3.2 Прогнозирование развития субклинического мастита у коров стафилококковой и стрептококковой этиологии 121
2.3.3.3 Штамм бактерий S. aureus, используемый в качестве тест-культуры для отбора антибактериальных средств 124
2.3.4 Биологические свойства энтерококков, выделенных от здоровых животных и животных с инфекционно-воспалительными заболеваниями 127
2.3.4.1 Персистентный потенциал бактерий рода Enterococcus, выделенных от животных с факторными инфекциями 127
2.3.4.2 Разработка способа дифференциации энтерококков кишечной микрофлоры животных 133
2.3.4.3 Разработка алгоритма для дифференциальной диагностики клинически значимых штаммов энтерококков и представителей нормальной микрофлоры животных 137
2.3.4.4 Анализ полного генома Enterococcus faecium ICIS 96 141
2.3.5 Биологические свойства Candida spp., выделенных из кишечника цыплят-бройлеров 143
2.3.5.1 Факторы патогенности и персистенции Candida spp. 143
2.3.5.2 Антибиотикорезистеность Candida spp., выделенных из помета цыплят-бройлеров 146
2.4 Регуляция персистентного потенциала микроорганизмов факторами различного генеза 150
2.4.1 Выделение антимикробных пептидов, их антимикробная активность и влияние на персистентные свойства 150
2.4.1.1 Способ получения антимикробных пептидов из тромбоцитов курицы домашней 150
2.4.1.2 Биологическая активность антимикробных пептидов из тромбоцитов кур 156
2.4.1.3 Влияние антимикробных пептидов из тромбоцитов кур на персистентные свойства микроорганизмов 161
2.4.1.4 Функциональная активность синтетического производного индоли-цидина 164
2.4.2 Взаимодействие симбионтов в микросимбиоценозе при инфекции 167
2.4.2.1 Модификация факторов персистенции стафилококков и M. pachydermatis при межмикробных взаимодействиях 167
2.4.2.2 Модификация факторов персистенции Candida albicans под влиянием энтерококков 170
2.4.2.3 Штамм бактерий Enterococcus faecium 18, обладающий способностью снижать образование биопленок грибами рода Candida 173
2.4.3 Регуляция персистентных свойств микроорганизмов фитосубстанция ми 178
2.4.3.1 Влияние на факторы персистенции микроорганизмов эфирных масел лекарственных растений 179
2.4.3.2 Антиперсистентное действие эфирных масел полыни 184
2.4.3.3 Влияние растительных экстрактов хвойных растений на способность микроорганизмов к инактивации лизоцима и формированию биопленок 192
2.4.3.4 Влияние фитосубстанций, обладающих антиоксидантной активностью, на персистентные свойства микроорганизмов 197
2.4.3.5 Разработка алгоритма отбора лекарственных растений для использования в комплексной терапии эндогенных инфекций 202
Заключение 208
Выводы 225
Рекомендации по использованию научных выводов 227
Список сокращений 228
Библиографический список 230
