Введение
ГЛАВА 1. Обзор литературы роль генетических и эпигенетических факторов в контроле точности трансляции у эукариот 7
1.1. Общая характеристика процесса трансляции у эукариот 7
1.2. Принцип поливариантности матричных процессов
1.2.1. Неоднозначность трансляции 12
1.2.2. Типы ошибок при трансляции
1.3. Генотипическая и фенотипическая супрессия 14
1.4. Нонсенс-супрессия и антисупрессия как модели для изучения молекулярных механизмов, контролирующих неоднозначность трансляции.14
1.5. Генетический контроль считывания стоп-кодонов у эукариот
1.5.1. Считывание стоп-кодонов мутантными тРНК и тРНК дикого типа...16
1.5.2. Роль рРНК и рибосомных белков в нонсенс-супрессии 18
1.5.3. Нонсенс-супрессия и факторы элонгации 22
1.5.4. Мутации по факторам терминации и считывание стоп-кодонов 25
1.5.5. Роль системы NMD в контроле нонсенс-супрессии 30
1.5.6. Другие факторы, влияющие на эффективность считывания стоп-кодонов 36
1.6. Эпигенетические факторы, влияющие на эффективность считывания
стоп-кодонов 40
1.6.1. Прионный детерминант [PSI+] 41
1.6.2. Прионный детерминант [PIN+] 44
1.6.3. Прионный детерминант [NSI+] 46
1.6.4. Прионный детерминант [ISP+] 46
1.7. Заключение 49
ГЛАВА 2. Материалы и методы 51
2.1. Штаммы 51
2.2. Плазмиды 52
2.3. Среды и условия культивирования 56
2.4. Генетические методы 57
2.5. Молекулярно-генетические и биохимические методы 57
2.6. Биоинформационные и статистические методы 63
ГЛАВА 3. Результаты 66
3.1. Влияние детерминанта [ISP+] на экспрессию генов SUP35 и SUP45 66
3.1.1. Количество мРНК генов SUP35 и SUP45 в штаммах [ISP+], [isp-] и sfp1 66
3.1.2. Количество белков Sup35 и Sup45 в штаммах [ISP+], [isp-] и sfp1
3.2. Сверхэкспрессия мутантной аллели гена SUP35 приводит к антисупрессии 71
3.3. Влияние сверхэкспрессии гена SFP1 на проявление мутаций sup35 и sup 45
3.3.1. Влияние сверхэкспрессии гена SFP1 на проявление мутаций sup35. 73
3.3.2. Анализ природы антисупрессии, вызванной повышенной экспрессией гена SFP1 77
3.3.3. Влияние сверхэкспрессии гена SFP1 на экспрессию гена SUP35 80
3.3.4. Влияние сверхэкспрессии гена SFP1 на проявление мутаций sup45. 83
3.3.5. Влияние сверхэкспрессии гена SFP1 на экспрессию аллели дикого типа и мутантных аллелей гена SUP45
3.4. Определение последовательности гена SFP1 в штамме 25-25-2В-П3982 и в плазмиде pRS426-SFP1 90
3.5. Анализ продукции белков Sup35 и Sup45 в штамме, несущем делецию гена SFP1 или нормальную аллель этого гена 93
ГЛАВА 4. Обсуждение 96
Выводы 105
Список литературы
