Введение
Глава 1. Обзор литературы 13
1.1 Разнообразие и функции микроорганизмов, ассоциированных с насекомыми 13
1.1.1 Места обитания микроорганизмов у насекомых 13
1.1.1.1 Кутикула 14
1.1.1.2 Кишечный канал 15
1.1.2 Таксономическое разнообразие микроорганизмов 16
1.1.3 Влияние микроорганизмов на фенотип насекомых 17
1.1.3.1 Питание 17
1.1.3.2 Защита от естественных врагов 19
1.1.3.3 Детоксикация токсинов: аллелохимические вещества растений и инсектициды 22
1.2 Биоразнообразие отряда Coleoptera 23
1.2.1 Семейство Scarabaeidae 26
1.2.2 Семейство Cucujidae 26
1.2.3 Семейство Pyrochroidae 27
1.2.4 Семейство Cerambycidae 28
1.3 Симбиотические взаимоотношения представителей отряда Coleoptera с различными микроорганизмами 30
1.3.1 Прокариотические сообщества кишечного канала отряда Coleoptera 33
1.3.2 Грибные сообщества кишечного канала отряда Coleoptera 36
1.4 Методы молекулярной биологии в исследовании различных микробиомов 38
1.5 Заключение 40
Экспериментальные исследования 41
Глава 2. Материалы и методы 41
2.1 Сбор материала и препарирование личинок 41
2.2 Идентификация личинок жуков 43
2.3 Анализ микробных сообществ кишечного канала у различных личинок 44
2.4 Реконструкция метагеномов бактериальных сообществ 46
2.5 Математическая обработка данных 46
Глава 3. Результаты исследований 47
3.1. Идентификация жесткокрылых 47
3.2 Разнообразие микробных сообществ в кишечном канале личинок семейств Scarabaeidae, Cucujidae и Pyrochroidae 49
3.2.1 Бактериальные сообщества, ассоциированные с кишечником личинок семейств Scarabaeidae, Cucujidae и Pyrochroidae 49
3.2.2 Архейные сообщества, ассоциированные с кишечником личинок семейств Scarabaeidae 55
3.2.3 Грибные сообщества, ассоциированные с кишечником личинок семейств Scarabaeidae, Cucujidae и Pyrochroidae 57
3.3 Разнообразие микробных сообществ в кишечном канале личинок семейства Cerambycidae 61
3.3.1 Бактериальные сообщества, ассоциированные с кишечником личинок семейства Cerambycidae 61
3.3.2 Грибные сообщества, ассоциированные с кишечником личинок семейства Cerambycidae 71
3.3.3 Реконструкция метагеномов бактериальных сообществ с применением программного обеспечения PICRUSt 78
Глава 4. Обсуждение результатов 85
4.1 Микробные сообщества пищеварительного тракта личинок жуков семейств Scarabaeidae, Cucujidae и Pyrochroidae 85
4.2 Микробные сообщества пищеварительного тракта личинок жуков семейства Cerambycidae 92
Заключение 103
Список сокращений и условных обозначений 105
Список литературы 106
