Введение
Глава 1. Общие сведения о ферменте 14
1.1. Энергетические ресурсы клетки 14
1.2. Общая характеристика FiFo-АТРсинтазы 18
1.3. Пространственное строение АТРсиптазы 20
1.4. Каталитические центры Fi-АТФазы 21
1.5. Каталитический цикл. Двух- и трех- центровий механизм катализа 23
1.6. Структурные перестройки Fi-АТРазы (вращение ротора) 26
1 7. Теоретические модели мотора Fi-АТФазы 33
Выводы 38
Глава 2. Электростатические взаимодействия в каталитических центрах F,-ATPa3bi 39
2.1. Вычисление энергии фермент-субстратного комплекса 39
2.2. Конформационпые состояния фермент-субстратного комплекса. 41
2.3. Результаты расчетов и их обсуждение 43
2.4. Обсуждение результатов 56
Выводы 58
Глава 3. Стохастическая модель молекулярного мотора Р АТФазы 59
3.1. Потенциалы взаимодействия ротора и статора молекулярного мотора 60
3.2. Основные уравнения 67
3.3. Численное решение уравнений 71
3.4. Результаты численного моделирования работы мотора по вращению нагрузки 74
Выводы 84
Глава 4. Синтез АТФ Fj-АТАФазой в стохастической модели 85
4.1. Последовательность событий в режиме синтеза АТФ 85
4.2. Основные уравнения 87
4.3. Результаты численного моделирования синтеза АТФ под действием постоянного внешнего вращающего момента 89
Выводы 98
Заключение 100
Литература 103
