Введение
Глава 1. Обзор литературы 10
1. Исследование структуры мембранных белков. Мембрано-моделирующие среды 10
1.1. Общие сведения о мембранных белках 10
1.2. Метод ЯМР и его применение к мембранным белкам 12
1.3. Свойства различных типов мембранных миметиков . 19
2. Липид-белковые нанодиски 28
2.1. Липопротеины плазмы крови млекопитающих . 28
2.2. Структура и свойства ЛБН 31
2.3. Использование ЛБН для солюбилизации мембранных белков и пептидов 33
2.4. ЛБН в ЯМР-спектроскопии высокого разрешения . 35
3. Потенциал-зависимые ионные каналы 37
3.1. Общая схема строения катионных каналов 38
3.2. Классификация каналов 41
3.3. Принципы потенциал-зависимой активации 49
Глава 2. Материалы и методы 59
1. Получение объектов исследования и реактивы 59
1.1. Получение Антиамебина I 59
1.2. Наработка и выделение ВСД-KvAP 59
1.3. Реактивы 60
1.4. Получение ЛБН в комплексе с ВСД-KvAP и ААМ I . 60 2. Экспериментальные методики 61
2.1. Подбор условий для структурных ЯМР-исследований ВСД-KvAP . 61
2.2. Исследование ААМ I и ВСД-KvAP в комплексе с ЛБН 62
2.3. Анализ размера частиц 63
2.4. Структурные исследования ВСД-KvAP 66
2.5. Определение динамических характеристик ВСД-KvAP 67
2.6. Расчет химических сдвигов 69
Глава 3. Результаты и обсуждение 70
1. Подбор мембраномоделирующей среды 70
2. ЛБН в качестве мембраномоделирующей среды 75
2.1. Исследование AAM-I в комплексе с ЛБН методом ЯМР 76
2.2. ЯМР-исследование ВСД-KvAP в комплексе с ЛБН . 79
3. Структура ВСД-KVAPB мицеллах 81
3.1. Отнесение сигналов 81
3.2. Вторичная структура ВСД-KvAP в мицеллах 83
3.3. Данные о пространственной структуре ВСД-KvAP . 86
3.4. Расчет химических сдвигов 89
3.5. Выводы о структуре ВСД-KvAP в мицеллах ДФХ/ЛДАО 90
4. Внутримолекулярная динамика ВСД-KvAP в мицеллах ДФХ/ЛДАО 91
Заключение 95
Выводы 97
Благодарности 98
Список сокращений 99
Литература
