Введение
Глава 1. Таксономия прокариот, современное состояние и основные методы исследования . 12
Глава 2. Таксономическая структура класса "Gammaproteobacteria" тип Proteobacteria 23
2.1. Семейство Alteromonadaceae 24
2.2. Семейство Moraxellaceae .30
2.3. Семейство Hatomonadaceae , 32
2.4. Бактерии группы Oceanospirillum (семейство "Oceanospirillaceae") 35
Глава 3. Бактерии рода Pseudoalteromonas и родственные бактерии - продуценты вторичных метаболитов 37
Экспериментальная часть.
Глава 4. Объекты и методы исследования 50
4.1. Источники выделения бактерий , 50
4.2. Состав сред и условия культивирования микроорганизмов 51
4.3. Физиолого-биохимические тесты 51
4.4. Методы изучения морфологии 52
4.5. Получение экстрактов клеток 52
4.6. Исследование липидного состава н полисахаридов 53
4.7. Изучение геномных характеристик 53
4.7.1. Выделение ДНК, определение нуклеотидного состава и ДНК-ДНК гибридизации 53
4.7.2. Риботипирование 54
4.8. Секвенирование 16S рибосомных ДНК генов 55
4.9. Филогенетический анализ 55
4.10. Методы определения активности ферментов
4.10.1. Определение нуклеазной активности 55
4.10.2. Определение тирозиназной активности ...57
4.11. Определение антагонистических свойств 57
Результаты и обсуждение.
Глава 5. Род Pseudoalteromonas и родственные бактерии семейства A Iteromonadaceae 58
5.1. Характеристика новых видов агаролитических бактерий Pseudoalteromonas agarivorans и Pseudoalteromonas mariniglutinosa 58
5.2. Меланин-синтезирующие бактерии рода Pseudoalteromonas и их особенности
5.2.1. Реклассификация Alteromonas distincta как Pseudoalteromonas distincta 73
5.2.2. Таксономические особенности вида "Alteromonasfuliginea" 75
5.3. Уровни ДНК-ДНК сходства и филогенетические связи непигментированных видов рода Pseudoalteromonas. Реклассификация Pseudoalteromonas haloplanktis subsp. tetraodonis как Pseudoalteromonas tetraodonis 78
5.4. Бактерии рода Pseudoalteromonas — продуценты ферментов 83
5.4.1. Бактерии рода Pseudoalteromonas - продуценты нуклеаз 83
5.4.2. Таксономические особенности глубоководной бактерии "Alteromonas haloplanktis* КММ 223 - продуцента полиуридил-специфической эндорибонуклеазы 88
5.4.3. Тирозиназная активность бактерий рода Pseudoalteromonas 92
5.4.4. Биологическая активность бактерий рода Pseudoalteromonas, ассоциированных с асцидией Halocynthia aurantium 97
5.5. Психрофильные бактерии рода Glaciecola и особенности нового вида Glaciecola mesophila 106
5.6. Глубоководные бактерии рода Idiomarina 114
5.7. Характеристика полисахаридов штаммов бактерий рода Pseudoalteromonas и Idiomarina zobellli 120
Глава 6. Биологические особенности нового вида бактерий Haiomonas halocynthiae - ассоцианта асцидии Halocynthia aurantium 126
Глава 7. Психротолерантные бактерии рода Psychrobacter из морской среды и их особенности 135
7.1. Psychrobacter submarinus и Psychrobacter marincola — новые галофильные бактерии рода Psychrobacter 135
7.2. Видовое разнообразие и таксономическая характеристика бактерий рода Psychrobacter изолированных из образцов морского льда и донных осадков Японского моря 146
Глава 8. Новые таксоны бактерий группы OceanospirUlum 158
8.1. Marinomonasprimoryensis - новый внд психрофильных бактерий рода Marinomonas... 158
8.2. Oceanisphaera litoralis gen. nov., sp. nov., галофильная гаммапротеобактерна из морских донных осадков 165
Глава 9. Новые таксоны морских гаммапротеобактерий, не входящие в состав каких-либо известных семейств 171
9.1. Новый род гамма-протеобактерий Reinekea sedimentorum gen. nov., sp. nov 171
9.2. Новый вид глубоководных галотолерантных бактерий Rheinheimera pacifica sp. nov. 179
Заключение 188
Выводы 190
Список литературы 200
