Введение
Глава I. Ретроэлементы и их влияние на реорганизацию генома и функционирование клетки . 5
I. Краткая характеристика ретроэлементов 5
LINE-ретротранспозоны. 7
SINE-ретротранспозоны . 7
Процессированные псевдогены. 8
LTR-ретротранспозоны и эндогенные ретровирусы. 8
Интроны группы II (ретроинтроны). 9
Penepole - подобные элементы. 10
II. Роль мобильных элементов в реорганизации генома и клеточном функционировании .
1. Интеграция ретротранспозонов в геном и её роль в возникновении новых химерных элементов. 11
2. Образование новых клеточных белков при использовании промоторов, сигнала полиаденилирования, а также сайтов сплайсинга ретроэлементов . 13
Образование альтернативных транскриптов при использовании промоторов ретроэлементов. 14
Терминация транскрипции на сигнале полиаденилирования ретроэлементов и ее роль в образовании новых форм клеточных белков. 16
Образование химерных генов за счет альтернативного сплайсинга. 17
3. Повторяющиеся элементы и рекомбинация. 20
4. Ы-трансдукция. 24
5. Активность антисмыслового промотора. 24
6. Псевдогены и образование химерных элементов. 25
7. Смена матриц при обратной транскрипции (на примере ретровирусов). 27
8. Влияние кодируемых автономными ретроэлементами белков
на функционирование клетки. 30
Глава II. Регуляция экспрессии клеточных генов посредством РНК-интерференции и применение данного метода в научных исследованиях . 33
I. Посттранскрипционная регуляция генной активности. 33
Образование коротких дцРНК. 34
Сборка активного RISC. 37
Функционирование образовавшегося активного RISC . 38
II. Регуляция активности генов на уровне ДНК. 41
РНК-опосредованное метилирование ДНК. 41
РНК-опосредованное формирование гетерохроматина. 43
Удаление участков ДНК в процессе формирования макронуклеуса ресничных простейших. 45
Инактивация неспаренной в ходе мейозаДНК 46
III. Применение РНК-интерференции в молекулярно-генетических исследованиях . 48
Экспериментальная часть.
Обоснование работы и поставленные задачи. 51
Материалы и методы. 52
Результаты и их обсуждение. 66
Поиск химерных ретрогенов, образующихся за счет смены матрицы при обратной транскрипции ретроэлементов LI, в геномах эукариот . 66
Изучение влияния человек-специфических ретроэлементов
HERV-K (HML-2) на транскрипцию близлежащих генов. 79
Выводы. 89
Список литературы.
