Введение
Глава 1. Обзор литературы 6
1.1. Химические факторы коммуникации 6
1.1.1. Межклеточные взаимодействия опосредованные химическими факторами 7
1.1.2. Споруляция и компетентность (в. subtilis) 9
1.1.3. А-фактор в регуляции стрептомицетов.
1.1.4. Деление клеток. 12
1.1.5. Белки семейства rpf- стимуляторы роста бактерий 13
1.2. Межклеточные взаимодействия опосредованные физическими факторами (межклеточные контакты) 15
1.2.1.Биоплёнки 17
1.2.2. Бактериальные колонии. 21
1.3. Апоптоз в микробных сообществах 29
1.4. Клеточная стенка и её роль в коммуникации бактерий 32
1.5. Агрегация бактерий в жидких средах 40
Глава 2. Материалы и методы 46
2.1. Выращивание бактериальных культур 46
2.2. Общее число клеток (очк) 46
2.3. Микроскопические исследования 46
2.4. Распределение клеток 47
2.5. Разрушение бактериальных агрегатов исследуемых культур 47
2.6. Получение супернатантов для стимуляции роста бактерий 48
2.7. Электрофорез белков в пааг по лэммли 48
2.8. Иммуноблоттингрекомбинантных белков 49
2.9. Иммуноферментный анализ 50
2.10. Получение белка rpf и его модифицированных форм 51
2.11.Секвенирование белков 52
2.12. Масспектрометрия 52
2.13. Приготовление грубого препарата клеточных стенок м. luteus 52
2.14. Измерение литической активности белка rpf в отношении грубого препарата клеточных стенок м. luteus 52
2.15. Определение мурамидазной активности белков rpf и его модификаций 53
2.16. Гель-фильтрация сн со стимулирующей активностью 53
2.17. Тестирование фракций супернатанта м. luteus на активность стимулирующую рост клеток 54
2.18. Ультрафильтрация сн со стимулирующей активностью 54
Глава 3. Результаты 57
3.1. Ингибирующее влияние интенсивного перемешивания на рост культур rhodococcus rhodochrous и micrococcus luteus в жидких обеднённых средах 57
3.2. Клеточная агрегация на ранних стадиях развития бактериальных культур r. rhodochrous и м. luteus и её механизмы 65
3.3 Роль белка rpf в дезагрегации клеточных ассоциатов м. luteus 82
Глава 4. Обсуждение 99
Выводы 108
Список литературы 109
