Введение
2. Обзор литературы
2.1. Влияние ретроэлементов на структуру генома 8
2.2. Функциональные последствия инсерции ретроэлементов 14
2.3. Транспозиционная активность мобильных элементов в соматических клетках 17
2.4. Ретроэлементы и мозг 29
3. Результаты и обсуждение 34
3.1. Выбор образцов для исследования 34
3.2. Использование метода супрессионной ПЦР для создания полногеномных библиотек фланкирующих последовательностей ретроэлементов 3 5
3.3. Биоинформатический анализ данных секвенирования фланкирующих последовательностей ретроэлементов 40
3.4. Общая характеристика полученных библиотек фланкирующих последовательностей ретроэлементов 45
3.5. Валидация потенциальных соматических инсерции ретроэлементов 47
3.6. Амплификация валидированных соматических инсерции с геномной ДНК в качестве матрицы 51
3.7. Оценка специфичности метода получения библиотек фланкирующих последовательностей ретроэлементов 53
3.8. Оценка эффективности метода получения библиотек фланкирующих последовательностей ретроэлементов 56
3.9. Анализ распределения соматических инсерции ретроэлементов в анализируемых образцах тканей 58
3.10. Анализ геномного распределения соматических инсерции 61
3.11. Анализ ориентации соматических инсерции ретроэлементов относительно расположенных рядом генов 65
4. Материалы и методы
4.1. Материалы
4.2. Методы выводы
Список литературы
