Введение
Глава 1. Обзор литературы 7
1.1. Систематика и таксономическое строение рода Allium L. 7
1.2. Секция Allium 13
1.2.1. Чеснок Allium sativum 14
1.2.1.1. Происхождение, история возделывание и использование
14 Allium sativum
1.2.1.2. Ботаническая характеристика Allium sativum 15
1.2.1.3. Размножение Allium sativum 17
1.3. Геном растений и методы его исследования 18
1.3.1. Молекулярные методы анализа генома растений 19
1.3.1.1. Метод AFLP-анализа 20
1.3.1.2. Метод NBS-профайлинга 21
1.3.1.3. Анализ полиморфизма межгенных спейсеров и интронов ядерного и цитоплазматических геномов для изучения таксономии и филогении растений 21
1.3.2. Молекулярный анализ геномов Allium sativum и родственных видов 24 Allium
Глава 2. Материалы и методы 30
Глава 3. Результаты и обсуждение 39
3.1. Анализ полиморфизма генома чеснока A. sativum методами мультилокусного анализа 49
3.1.1. Анализ внутривидового полиморфизма генома чеснока A. sativum методом AFLP-анализа
3.1.2. Анализ полиморфизма семейства генов резистентности в геноме чеснока A. sativum методом NBS-профайлинга
3.2. Анализ полиморфизма генома лука-порея A. porrum методом AFLP 55
3.3. Анализ полиморфизма генома представителей секции Allium рода Allium методами мульти-и монолокусного анализов
3.3.1. Анализ межвидового полиморфизма у представителей секции Allium методом AFLP
3.3.2. Анализ нуклеотидных последовательностей некодирующих участков генома у образцов секции Allium рода Allium 69 82
3.3.2.1. Анализ вариабельности последовательности ядерного рибосомального оперона ITS1-5.8S-ITS2
3.3.2.2. Анализ полиморфизма участков пластидного генома у представителей секции Allium
3.3.2.3. Анализ полиморфизма последовательности b/c интрона митохондриального гена nad1
3.3.2.4. Филогения секции Allium на основе анализа некодирующих участков генома 93
3.4. Секвенирование и анализ полной последовательности пластидного генома Allium sativum
3.5. Идентификация и анализ новых генов у видов рода Allium, ассоциированных с устойчивостью к холодовому стрессу
3.5.1. Идентификация и анализ CSP-генов 93
3.5.1.1. Идентификация и анализ CSP-генов у видов Allium 93
3.5.1.2. Идентификация и анализ CSP-генов у видов рода Brassica 99
3.5.2. Сравнительный анализ аминокислотных последовательностей CSPs Allium и Brassica
108
3.5.3. Анализ экспрессии генов AsCSP1, AsCSP2 и AsCSP3
вегетативных органах Allium sativum
Заключение 112
Выводы 115
Список сокращений 116
Публикации по теме диссертации 117
Список литературы
