Введение
ЧАСТЬ 1. Новые crispr-cas системы 2 класса 38
Биоинформатический подход для поиска новых локусов CRISPR–Cas 2 класса 38
Подтипы V-B и V-C обнаруженные с использованием cas1 затравки: большие мульти-доменные эффекторы 47
Подтип V-U определённый с помощью CRISPR затравок: маленький возможный эффектор
Подтипы VI-A, VI-B и VI-C найденные с помощью cas1 и CRISPR затравок: РНК таргетирующие CRISPR–Cas многоблоковые эффекторы 56
ЧАСТЬ 2. Оценка разнообразия систем 2 класса и обновлённая классификация crispr-cas систем 60
Оценка разнообразия CRISPR-Cas систем 2 класса в локусах бактерий и архей 60
Обновлённая классификация CRISPR–Сas систем 2 класса 62
ЧАСТЬ 3. Эволюционное возникновение новых crispr-cas систем 2 класса 63
Часть 4. Возможные применения для новых crispr-cas систем 69
Заключение 73
Результаты исследования 75
Список использованной литературы 76
Приложение 101
Благодарности 104
