ОГЛАВЛЕНИЕ
ВВЕДЕНИЕ ....................................................................................................................................... 3
1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ .................................................................................................................. 8
1.1. Бактерии рода Rhodococcus в промышленной биотехнологии ............................................. 8
1.2. Генетические инструменты для гетерологичной экспрессии генов в бактериях
Rhodococcus .................................................................................................................................. 11
1.3. Штамм Rhodococcus rhodochrous M8 и штаммы, производные от него ............................. 27
1.4. Металло-регуляция транскрипции в бактериях ................................................................... 30
1.5. Фермент ациламидаза как репортёрный и целевой белок ................................................... 34
2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ........................................................................................................ 40
2.1. Материалы, использованные в работе.................................................................................. 40
2.2. Методы исследования ........................................................................................................... 55
3. РЕЗУЛЬТАТЫ И ИХ ОБСУЖДЕНИЕ ....................................................................................... 63
3.1. Биоинформатический анализ генома Rhodococcus rhodochrous M8 для выявления
предполагаемых генетических элементов, вовлечённых в кобальт-зависимую регуляцию
транскрипции генов нитрилгидратазы ........................................................................................ 63
3.2. Разработка тест-системы для идентификации и изучения генетических элементов,
вовлечённых в кобальт-зависимую регуляцию транскрипции генов нитрилгидратазы ........... 86
3.3. Идентификация и изучение функционирования генетических элементов, вовлечённых в
кобальт-зависимую регуляцию транскрипции генов нитрилгидратазы .................................... 96
3.4. Конструирование биокатализаторов синтеза N-замещённых акриламидов на основе
штаммов Rhodococcus rhodochrous и элементов системы экспрессии «Pnh569 – cblA» ........... 138
ЗАКЛЮЧЕНИЕ ............................................................................................................................. 147
СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ И УСЛОВНЫХ ОБОЗНАЧЕНИЙ ................................................... 151
СЛОВАРЬ ТЕРМИНОВ ................................................................................................................ 154
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ ............................................................................................................. 156
СПИСОК ИЛЛЮСТРАТИВНОГО МАТЕРИАЛА ...................................................................... 172
ПРИЛОЖЕНИЕ А Список регуляторных областей и промоторов, использованных для
экспрессии генов в Rhodococcus ................................................................................................... 182
ПРИЛОЖЕНИЕ Б Параметры возбуждения и излучения флуоресценции белков TurboGFP и
TurboRFP ........................................................................................................................................ 202
