Введение
Глава 1. Особенности принятия решений при прогнозировании активности хонформацнонно-гибких органических соединений .. 9
1.1 Задача прогнозирования свойств органических соединений 9
1.2.Методы описания структуры органического соединения 10
1.3 Методы формирования гипотез о зависимости между структурой молекулы и ее свойствами 16
1.4 Принятие решений при прогнозировании активности конформационно-гибких соединений 21
Краткие выводы 25
Глава 2. Системный подход к поддержке принятия решений при прогнозировании активности хонформационно-гибких соединений 26
2.1 Основные принципы системного анализа 26
2.2 Описание процедуры прогнозирования активности с помощью методов структурного системного анализа 27
2.3 Учет информационной гибкости соединений при дальнейшей детализации диаграмм ; структурного системного анализа 34
2.4 Концептуальная модель данных 40
2.5 Эпистемологическая модель данных.. 42
Краткие выводы. 46
Глава 3. Метод комплексных интервальных моделей для прогнозирования активности конформационно-гибких соединений .. 47
3.1 Методы интервального анализа 47
3.2 Формальное определение значимости параметров49
3.3 Формальное построение гипотез 57
3.4. Формальное определение прогнозов активности конформационно-гибких соединени 59
3.5 Методика прогнозирования активности конформационно-гибких соединений с учетом
неоднозначности зависимости "структура— активность" 65
Краткие выводы— 71
Глава 4. Прототип системы поддержки принятия решений при прогнозировании активности конформационно-гибких соединений в виде системы ограничений 72
4.1 Методы программирования в ограничениях 72
4.2 Применение методов программирования в ограничениях для прогнозирования активности 74
4.3 Прогнозирование качественных значений активности 76
4.4 Прогнозирование численных значений активности 80
4.5 Совместное разрешение системы ограничений 83
Краткие выводы 85
Глава 5. Система поддержки принятия решений при прогнозировании активности конформационно-гибких соединений 86
5.1 Архитектура и особенности функционирования СППР. 86
5.2 Подсистема формирования описаний соединений 87
5.2.1 Генерация конформаций 89
5.2.2 Проверка полноты набора конформеров91
5.2.3 Отбор энергетически приемлемых конформеров 91
5.2.4 Расчет границ интервалов значений параметров. 93
5.2.5 Идентификация атомов в молекуле соединения... 95
5.2.6 Ввод значений активности 97
5.2.7 Подготовка к формированию гипотез 98
5.3 Подсистема распределенных вычислений при оптимизации структуры молекул. 102
5.4 Подсистема установления значимости параметров- 109
5.4.1 Формальная проверка значимости параметров для соединений, активность которых задана численно 109
5.4.2 Формальная проверка значимости параметров для соединений, активность которых задана качественно 111
5.4.3 Принятие решения о значимости параметра 112
5.4.4 Формирование гипотез 114
5.5 Прогнозирование активности соединений тестовой выборки... 116
5.5.1 Подготовка к прогнозированию активности 116
5.5.2 Прогнозирование численных значений активности 1 IT"
5.5.3 Прогнозирование качественных значений активности 119
Краткие выводы 121
Глава 6. Применение СППР для прогнозировании активности конформационно-гибких соединений ... 122
6.1 Прогнозирование ингибирующей активности ненуклеозидных ингибиторов обратной
транскриптазы 122
6.1.1 Общие положения 122
6.1.2 Прогнозирование 50% ингибирующей концентрации производных тетрагидроимидазобензодиазипенона 123
6.1.3 Уточнение гипотез на основе кристаллографических давных 132
6.1.4 Построение и оценка прогностической способности регрессионных моделей 135
6.1.5 Прогнозирование 50% ингибирующей концентрации производных фенилэтиларилтиомочевины 141
6.2 Прогнозирование противотуберкулезной активности производных дитиокарбаминовой кислоты 147
6.3 Прогнозирование свойств ряда производных хлорофилла 157
6.4 Прогнозирование сродства полихлоргидроксибифенилов к эстрогенному рецептору 165
Краткие выводы 168
Заключение :. 169
Литература 171
