Введение
ГЛАВА 1. Обзор литературы 8
1.1. Род тобамовирус (tobamovirus): представители и краткая характеристика 8
1. 1.1. Вирус зеленой крапчатой мозаики огурца 9
1.1.2. Вирус табачной мозаики 12
1.2. Организация геномов вируса табачной мозаики и вируса зеленой крапчатой мозаики огурца 14
1.3. Хранение и передача генетической информации вируса 16
1.3.1. Стабильность вирусного генома обеспечивают структуры на 5- и З-кониах 17
1.3.2. Трансляция и образование вирусных репликаз 18
1.3.3. Репликация геномной РНК ВТМ. 20
1.3.4. Субгеномные мРНК 24
1.4. Транспорт ВТМ 27
1.4.1. Межклеточный транспорт вируса. 27
1.4.2. Сборка вирионов 32
1.4.3. Дальний транспорт вируса 33
1.5. Защитная система растения 35
1.5.1 Сайленсин? РНК. 35
1.5.2. Феномен перекрестной защиты 44
1.5.3. Сверхчувствительная реакция 46
1.5.5. Убиквитинирование 48
Цели и задачи 50
ГЛАВА 2. Материалы и методы 51
2.1. Материалы 51
2.2. Методы 53
2.2.1. Выделение вирусных штаммов и заражение растений 53
2.2.2.Очистка вирусных частиц и выделение вирусной РНК. 57
2.2.3. Синтез первой цепи кДНКс помощью обратной транскрипции и полимеразная цепная реакция 58
2.2.4. Выделение фрагментов ДНК из агарозного геля или путем прямого осаждения 59
2.2.6. Автоматическое секвенирование 60
2.2.7. Твердофазный гетерогенный иммуноферментный анализ (ИФА) 60
ГЛАВА 3. Результаты и обсуждение 62
3.1. Изучение штаммов взкмо 62
3.1.1. Определение первичных структур геномов штаммов МС-1, МС-2, ВИРОГ-43М 62
3.1.2. Определение круга растений-хозяев штамма МС-1 63
3.1.3. Сравнение нуклеотидных и аминокислотных последовательностей геномов и белков штамма МС-1 и других представителей тобамовирусов 65
3.1.4. Множественное выравнивание и филогенетический анализ аминокислотных и нуклеотидных последовательностей белков штамма МС-1 и тобамовирусов 70
3.1.4. Сравнение нуклеотидных и аминокислотных последовательностей штамма МС-1 с известными штаммами ВЗКМО 74
3.1.5. Сравнительный анализ первичной структуры вакцинного штамма ВИРОГ-43Мс патогенными МС-1, МС-2 80
3.1.6. Динамика размножения в растениях огурца вакцинного штамма ВИРОГ-43М по сравнению с патогенными штаммами МС-1, МС-2 82
3.2. Изучение полиморфизма штаммов вмто 87
3.2.1. Сравнительный анализ первичных структур патогенных и аттенуированных штаммов ВМТо 87
3.2.2. Динамика размножения аттенуированных и патогенных штаммов ВМТо в растениях табака 91
3.3. Сравнение изучаемых аттенуированных штаммов вмто и взкмо с другими известными ослабленными штаммами тобамовирусов 96
Заключение 103
Выводы 105
Список литературы
