Введение
ГЛАВА 1 Литературный обзор 17
1.1 Рак молочной железы и неоадъювантная химиотерапия 17
1.2 Фенотип множественной лекарственной устойчивости 23
1.3 Характеристика отдельных подсемейств и представителей АВС-транспортеров 30
1.4 Регуляция экспрессии АВС-транспортеров и нормальная генетическая изменчивость
1.4.1. Генный полиморфизм 36
1.4.2. Однонуклеотидные полиморфизмы АВС-транспортеров 37
1.4.3. Однонуклеотидные полиморфизмы генов и экспрессия генов АВС 46
Заключение к литературному обзору 51
Глава 2 Материалы и методы 54
2.1 Материалы 54
2.1.1 Пациенты и лечение 54
2.1.2 База данных больных РМЖ 56
2.1.3 Забор опухолевого материала 59
2.2 Методы 60
2.2.1 Выделение РНК 60
2.2.2 Выделение ДНК 63
2.2.3 Горизонтальный и капиллярный электрофорез 65
2.2.4 Количественная ПЦР с обратной транскрипцией в режиме реального времени 67
2.2.5 Микроматричный анализ .69
2.2.6 Статистические методы 70
ГЛАВА 3 Результаты и обсуждение 73
3.1 Формирование скрипта и биоинформационный анализ данных 73
3.2 Полиморфизмы генов множественной лекарственной устойчивости 76
3.3 Доказательство существования функционального экспрессионного кластера генов лекарственной устойчивости и формирование ассоциативной сети 93
3.4 Панели однонуклеотидных полиморфизмов для прогноза направления изменения экспрессии кластера АВС-транспортеров 112
Заключение 121
Выводы .128
Список цитируемой литературы
