Введение
1 Обзор литературы .18
1.1 Устойчивость микроорганизмов к антимикробным препаратам как актуальная проблема ветеринарии и медицины 18
1.2 Современное представление о резистентности микроорганизмов к антимикробным препаратам, методы определения и существующие критерии оценки 23
1.3 Механизмы резистентности микроорганизмов к антимикробным препаратам разных классов. Детерминанты резистентности к антимикробным препаратам, выявленные у микроорганизмов, выделенных от животных и из продукции животноводства 29
1.4 Выделение штаммов микроорганизмов – возбудителей болезней сельскохозяйственных животных 38
1.4.1 Выделение штаммов Salmonella от сельскохозяйственных животных, из продуктов питания животного происхождения и кормов 38
1.4.2 Условно патогенные микроорганизмы как потенциальные возбудители инфекционных болезней сельскохозяйственных животных. Факторы вирулентности условно патогенных микроорганизмов 42
1.5 Чувствительность к антимикробным препаратам штаммов Salmonella, выделенных от сельскохозяйственных животных, продукции животного происхождения и кормов 52
1.6 Чувствительность к антимикробным препаратам штаммов условно патогенных микроорганизмов, выделенных от сельскохозяйственных животных и продукции животного происхождения 62
1.7 Профили резистентности устойчивых к антимикробным препаратам штаммов, выделенных от животных, из продуктов питания и кормов .67
1.8 Системы мониторинга устойчивости различных микроорганизмов к антимикробным препаратам, существующие в разных странах 71
1.9 Мероприятия по предотвращению возникновения резистентности и распространения устойчивых штаммов 82
1.10 Применение препарата Аргумистин в качестве альтернативы антимикробной терапии 87
1.11 Заключение по обзору литературы .89
2 Собственные исследования 94
2.1 Материалы и методы исследования .94
2.1.1 Материалы исследования 94
2.1.2 Методы исследования 96
2.1.2.1 Выделение культур микроорганизмов 96
2.1.2.1.1 Выделение культур Salmonella из патологического материала, продуктов животного происхождения и кормов 96
2.1.2.1.2 Выделение культур условно патогенных микроорганизмов из говядины 96
2.1.2.1.3 Выделение культур условно патогенных микроорганизмов из секрета молочных желез .98
2.1.2.1.4 Выделение культур микроорганизмов из фекалий .98
2.1.2.2 Идентификация выделенных культур 99
2.1.2.2.1 Идентификация по культурально-биохимическим свойствам 99
2.1.2.2.2. Идентификация методом времяпролетной масс-спектрометрии .99
2.1.2.2.3Серологическая идентификация .100
2.1.2.2.3.1 Серологическая идентификация штаммов Salmonella enterica 100
2.1.2.2.3.2 Серологическая идентификация штаммов Escherichia coli .100
2.1.2.3 Определение чувствительности к антимикробным препаратам 100
2.1.2.4 Интерпретация и анализ результатов определения чувствительности к антимикробным препаратам 101
2.1.2.5 Молекулярно-генетические исследования 102
2.1.2.5.1 Выделение микробной ДНК 102
2.1.2.5.2 Определение класса - лактамазы расширенного спектра 102
2.1.2.5.3 Определение точечных мутаций 104
2.1.2.5.4 Определение факторов вирулентности у Escherichia coli .105
2.1.2.6 Определение продукции токсинов у штаммов ЕНЕС 106
2.1.2.7 Определение вирулентности культур Klebsiella pneumoniaе для лабораторных животных 106
2.1.2.8 Определение гипермукоидного фенотипа у штаммов Klebsiella pneumoniaе 106
2.1.2.9 Изучение бактерицидного действия препарата Аргумистин 107
2.1.2.9.1 Опыт с нативным препаратом Аргумистин 107
2.1.2.9.2 Опыт с препаратом Аргумистин 0,8% 107
2.1.2.10 Применение препарата «Аргумистин» для лечения телят, больных диареей 108
2.1.2.11 Картографический анализ 109
2.1.2.12 Статистический анализ 110
2.2 Результаты исследований 112
2. 2.1 Эпизоотологический анализ выделения штаммов Salmonella от животных, из продукции животноводства и из кормов на территории Северо-Западного ФО в 2006 – 2016 гг 112
2.2. 2 Чувствительность к антимикробным препаратам микроорганизмов – возбудителей инфекционных болезней, выделенных от животных, из продукции животноводства и кормов на территории Северо-Западного ФО 127
2.2.2.1 Чувствительность к антимикробным препаратам штаммов Salmonella, выделенных от животных, из продукции животноводства и кормов .127
2.2.2.2 Чувствительность к антимикробным препаратам штаммов условно патогенных микроорганизмов, выделенных от животных и из продукции животноводства 146
2.2.2.2.1. Чувствительность к антимикробным препаратам штаммов Escherichia coli, выделенных из говядины 148
2.2.2.2.2 Чувствительность к антимикробным препаратам штаммов условно патогенных микроорганизмов, выделенных при мастите коров 151
2.2.2.2.3 Чувствительность к антимикробным препаратам штаммов Escherichia coli, выделенных от телят, больных острым колитом в ЗАО «Предпортовый» 158
2.2.4 Визуализация результатов исследования чувствительности микроорганизмов к антимикробным препаратам с помощью географической информационной программы QGis 172
2.2.5Профили резистентности и генетические детерминанты механизмов устойчивости микроорганизмов – возбудителей инфекционных болезней сельскохозяйственных животных к антимикробным препаратам 181
2.2.6 Предлагаемые принципы мониторинга чувствительности к антимикробным препаратам микроорганизмов – возбудителей инфекционных болезней сельскохозяйственных животных и мероприятия, направленные на предотвращение возникновения и распространения устойчивых штаммов микроорганизмов 188
2.2.7 Эпизоотологическое обследование ЗАО «Предпортовый» .190
2.2.8 Применение противомикробного препарата на основе наночастиц серебра Аргумистин как альтернативного средства антимикробной терапии животных 192
3 Обсуждение результатов 198
Заключение 231
Список сокращений .233
Список литературы 235
