Введение
1. Обзор литературы
Кинетические исследования механизмов ферментативных реакций в предстационарных условиях
1.1. ДНК- и РНК-полимеразы 14
1.1.1. ДНК-полимераза 1Escherichia coli (фрагмент Кленова) 17
1.1.2. РНК-полимераза бактериофага Т7 26
1.1.3. ДНК-полимеразы бактериофагов RB69 и Т4 35
1.1.4. ДНК-полимераза В 41
1.2. ДНК-лигаза бактериофага Т4 48
1.3. ДНК-метилтрансферазы 55
1.3.1. ДНК-метилтрансфераза Dam бактериофага Т4 56
1.3.2. ДНК-метилтрансфераза EcoRI 60
1.4. ДНК-гликозилазы 64
1.4.1. Урацил-ДНК-гликозилаза 67
1.4.2. Аденин-ДНК-гликозилаза 72
1.5. Заключение 76
2. Экспериментальная часть 77
3. Результаты и их обсуждение
Изучение предстационарной кинетики и конформационнои динамики оксогуанин-ДНК-гликозилаз Fpg из Е. coli и Oggl человека с ДНК
3.1. Формамидопиримидин-ДНК-гликозилаза Е. coli Fpg 90
3.1.1. Неспецифический ДНК-лиганд 95
3.1.2. F-лиганд 98
3.1.3. АР-субстрат 102
3.1.4. oxoG-субстрат 105
3.1.5. Влияние основания, расположенного напротив повреждения, на взаимодействие фермента с oxoG-субстратом
3.1.6. dHU-субстрат 119
3.1.7. Заключение по разделу 3.1 12
3.2. 8-оксогуанин-ДНК-гликозилаза человека hOggl 125
3.2.1. Неспецифический ДНК-лиганд 128
3.2.2. F-лиганд 129
3.2.3. АР-субстрат 130
3.2.4. oxoG-субстрат 132
3.2.5. Влияние основания, расположенного напротив повреждения, на взаимодействие фермента с oxoG-субстратом
3.2.6. Влияние 8-бромгуанина на взаимодействие фермента hOggl с АР- и oxoG-субстратами
3.2.7. Взаимодействие фермента hOggl с АР-эндонуклеазой человека (Apel)
3.2.8. Заключение по разделу 3.2 150
Заключение 153
Выводы 156
Список литературы 157
Благодарности 178
