Введение
Глава I. Литературный обзор 7
Глава 2. Постановка задачи и цели исследования 22
Глава 3. Оценка роли объемных и мембранных ферментативных реакций, участвующих в разрушении внеклеточного матрикса 24
3.1. Оценка времени, необходимого для разрушения матрикса в результате ограниченного протеолиза в объеме 25
3.2. Оценка кинетических констант ограниченного протеолиза коллагена на клеточной мембране 26
3.3. Роль диффузионных процессов в разрушении матрикса 29
Глава 4 Математическая модель активации илазминогена урокиназой с участием рецепторов и ингибиторов 31
4.1. Схема биохимических реакций 31
4.2, Математическая модель динамики активации плазминогена 31
4.3- Начальные условия 35
4.4. Программное обеспечение и результаты численных экспериментовЗб
Глава 5. Математическая модель разрушения ВКМ с участием урокиназо-плазминной системы 47
5.1. Описание математической модели 47
5.2. Упрощенная схема биохимических реакций разрушения матрикса - 52
5.3- Программное обеспечение и результаты численных экспериментов55
Глава 6. Математическая модель разрушения ВКМ металлопротеиназами (процессы in vitro) 64
6Л. Схема процесса 64
6.2. Математическая модель кинетики разрушения элементов внеклеточного матрикса металлопротеиназой МТ1-ММР 66
6.3. Постановка оптимизационной задачи (оптимальные концентрации прометаллопротеиназ и время запаздывания секреции ингибиторов) 71
6.4. Решение оптимизационной задачи 75
Глава 7. Разрушение коллагена типа 4 на поверхности клеточной мембраны: оптимизационная модель и динамика процесса 84
7.1. Критерий оптимальности системы разрушения матрикса 84
7.2. Динамическая модель разрушения коллагена типа IV 85
7.3. Оптимизационная задача 87
7.4. Результаты решения оптимизационной задачи: определение кинетических констант 89
7.5. Динамика разрушения коллагена 4 типа на поверхности клеточной мембраны 89
7.6. Обсуждение результатов, полученных в главе 7 92
Заключение 93
Выводы 97
Список литературы
