Введение
ГЛАВА 1. Обзор литературы. 12
1.1 Хромосомные аномалии. Характеристика, механизмы формирования и клиническая значимость 12
1.1.1 Геномные мутации .14
1.1.2 Роль геномных мутаций в репродуктивных потерях .16
1.1.3 Хромосомные мутации 18
1.1.4 Роль хромосомных мутаций в этиологии умственной отсталости 24
1.2 Методы диагностики хромосомных аномалий 26
1.2.1 Стандартный цитогенетический метод .27
1.2.2 Флуоресцентная in situ гибридизация (FISH) 29
1.2.3 Сравнительная геномная гибридизация (CGH) 32
1.2.3.1 Метафазная сравнительная геномная гибридизация – CGH .34
1.2.3.2 Сравнительная геномная гибридизация высокого разрешения – HR-CGH .36
1.2.3.3 Микроматричная сравнительная геномная гибридизация – аCGH .38
1.3 Метод CGH в диагностике хромосомного дисбаланса 39
1.3.1 CGH в онкоцитогенетике 39
1.3.2 CGH в клинической цитогенетике 41
1.3.3 CGH в преимплантационной диагностике 42
ГЛАВА 2. Материалы и методы исследования .44
2.1 Матерал для исследования .44
2.2 Приготовление хромосомных препаратов – «платформы» для CGH .44
2.3 Метафазная сравнительная геномная гибридизация – CGH 45
2.4 Флуоресцентная in situ гибридизация – FISH 50
2.5 Микроматричная сравнительная геномная гибридизация – аCGH .51
ГЛАВА 3. Результаты исследования и обсуждение .52
3.1 Оптимизация протокола приготовления хромосомных препаратов – «платформы» для CGH .52
3.2 Получение стандартных референсных интервалов для активации функции анализа высокого разрешения (HR-CGH) 60
3.3 Определение разрешающей способности HR-CGH на основе полученных стандартных референсных интервалов при анализе образцов ДНК с хромосомными аномалиями известного размера 65
3.4 Сравнительный анализ эффективности выявления хромосомных аномалий методом метафазной CGH при использовании фиксированных и стандартных референсных интервалов 3.5.1 Метафазная CGH в диагностике хромосомного дисбаланса при внутриутробной гибели плода на ранних этапах эмбриогенеза 83
3.5.2 HR-CGH в диагностике хромосомного дисбаланса у пациентов с умственной отсталостью, аномалиями развития и нормальным кариотипом, ранее установленным при стандартном цитогенетическом исследовании 93 ЗАКЛЮЧЕНИЕ 103 ВЫВОДЫ 106 ПРИМЕНЕНИЕ Результатов и научных выводов .107
Список сокращений и условных обозначений 108
Список работ, опубликованных по теме диссертации 109
Список литературы
