Введение
Глава 1. Обзор литературы 22
1.1.Возбудители инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи 22
1.1.1. Acinetobacter baumannii 24
1.1.2. Klebsiella pneumoniae 29
1.1.3. Pseudomonas aeruginosa 33
1.2. Возбудители респираторных инфекций 46
1.2.1.Streptococcus pneumoniae 46
1.2.2. Sterptococcus pyogenes 55
Глава 2. Материалы и методы исследования 57
2.1. Выделение, идентификация и анализ госпитальных бактерий 57
2.1.1. Определение чувствительности к антибиотикам 58
2.1.2. Молекулярно-генетические методы исследования 60
2.1.3. Исследование биопленкообразования у штаммов A. baumannii 65
2.2. Выделение, идентификация и анализ респираторных патогенов 66
Глава 3. Госпитальные грамотрицательные бактерии 71
3.1. Динамика микробиоты, колонизирующей слизистые оболочки во время пребывания в ОРИТ, при анализе трахеального аспирата 71
3.2. Результаты микробиологического исследования крови 78
3.3. Результаты микробиологического исследования ликвора 83
Глава 4. Клональное разнообразие, молекулярные механизмы устойчивости к карбапенемам и биопленкообразование у карбапенемрезистентных штаммов A. baumannii, выделенных в г. Москве 87
4.1. Распределение клональных комплексов и сиквенс-типов согласно схемам Oxford и Pasteur 87
4.2. Определение чувствительности к антибиотикам и идентификация генов -лактамаз 92
4.3. Образование биопленок 93
Глава 5. Клональное разнообразие, молекулярные механизмы устойчивости к карбапенемам у карбапенемрезистентных штаммов K. pneumoniaе 97
5.1. Профиль чувствительности к антибиотикам изолятов K. pneumoniaе 97
5.2. Молекулярные механизмы устойчивости изолятов K. pneumoniae к -лактамным антибиотикам 99
5.3. Клональная структура популяции K. pneumoniae 100
Глава 6. Популяционная структура карбапенемрезистентных штаммов P. aeruginosa и носительство металло--лактамаз 105
6.1. Характеристика популяционной структуры карба-Р P. aeruginosa. 106
6.2. Носительство МБЛ-карбапенемаз 109
Глава 7. Респираторные патогены 111
7.1. Динамика распространенности серотипов и антибиотикорезистентности носоглоточных пневмококков, в выделенных в 2010-2016 гг 111
7.2. Динамика резистентности и клональная эволюция пневмококков серотипа 14 в 2010-2015 гг. 127
7.3. Клональная эволюция пневмококков серотипа 19А в 2002-2013 гг 136
7.4. Распространенность и механизмы устойчивости к макролидам S. pyogenes 152
Заключение 158
Выводы 179
Практические рекомендации 181
Перспективы дальнейшей разработки темы 182
Список сокращений. 183
Список литературы 185
