Введение
Глава 1.Обзор литературы8
1.1. Род Capsicum Z>: морфологическая, таксономическая и генетическая характеристика. 8
Общая морфологическая характеристика рода Capsicum L. 8
Систематика рода Capsicum L. 11
Эволюцыонно-филогенетические исследования культурных и дикорастущих видов рода Capsicum. Гипотезы происхождения культурных видов перца. 13
Происхождение и филогения культурных видов рода Capsicum L. 15
Внутривидовой полиморфизм представителей рода Capsicum L . 20
L2. Уникальные последовательности генома растений 24
1,3. Характеристика основных семейств генов растительного генома, 26
1.3. L Семейство генов устойчивости растений. 26
Общая характеристика семейства генов резистентности. 26
Эволюция генов резистентности. 30
1.3.2. Семейство MADS-tox генов. 31
Общая характеристика семейства MADS-box генов. 31
к АВСмодель» и семейство MADS-box генов. 33
1.3.3. Семейство генов протеинкиназ растений. 35
Общая характеристика генов протеинкиназ и их функции. 35
Классификация протеинкиназ 37
1.4. Повторяющиеся последовательности генома растений. 39
1.4.1. Фракция высокоповторяющейся ДНК. 40
Микросателлитные повторы. 40
Хлоропластные микросателлиты 42
43
1.4.2. Фракция умеренноповторяющейся ДНК: гены рРИК и их спейсерные участки
Общая структурно-функциональная характеристика рДНК. 43Согласованная эволюция повтороврДНК. 45
1.4.3. Фракция умеренно-повторяющейся ДНК: мобильные элементы генома растений 1.5. Молекулярные методы анализа растительного генома. 53
CLASS Глава 2. Материалы и методы. 6 CLASS 0
Глава 3. Результаты и обсуждение. 73
3.1. Использование молекулярных систем AFLP-, RAPD- и ISSR- маркирования для исследования генома рода Capsicum. 73
3.1.1. Анализ генома видов и сортов рода Capsicum методом AFLP. 73
AFLP-анализ межвидового полиморфизма рода Capsicum 76
AFLP-анализ внутривидового полиморфизма рода Capsicum 77
Использование метода AFLP для определения филогении видов рода Capsicum . 78
Анализ генома представителей рода Capsicum RAPD-методом. 81
3.1.2.1. RAPD-анализ межвидового и внутривидового полиморфизма и определение филогении видов рода Capsicum. 82
Анализ генома видов и сортов рода Capsicum методом ISSR-маркирования межмикросателлитных последовательностей. 86
. lSSR-анализ межвидового и внутривидового полиморфизма и определение филогении видов рода Capsicum 88
Комплексный анализ генетического разнообразия видов Capsicum chinense и Capsicum frutescens с использованием AFLP-f RAPD-, ISSR-систем молекулярного маркирования.
Комплексный анализ генома рода Capsicum с использованием AFLP-, RAPD-, ISSR-систем молекулярного маркирования.
3.1.6. Сравнительный молекулярный RAPD-и ISSR~ анализ генетического разнообразия родов Capsicum и Lycopersicon. ^""
3.2. Молекулярный анализ основных адаптивно значимых семейств генов (генов резистентности, MADS-box генов и генов, кодирующих проте инкиназы) у представителей рода Capsicum.
3.2.1. Молекулярный анализ семейства генов резистентности у представителей рода Capsicum 111
3.2.1.1. Общая характеристика полиморфизма RGA-фрагментов видов перца, выявленного при использовании метода NBS-маркирования. 111
3.2.1.2. Использование метода NBS-маркирования для определения филогении RGA-семейства у Capsicum. 113
3.2.1.3. Анализ нуклеотидных последовательностей полиморфных RGA- фрагментов. 115
3.2.2. Молекулярный анализ семейства MADS-box генов и их аналогову представителей рода Capsicum 117
3.2.2.1. Общая характеристика полиморфизма MADS-box содержащих последовательностей генома перца, выявленных при использовании метода MADS-маркирования. 117
3.2.2.2. Использование метода MADS-маркирования для определения филогении семейства MADS-содержащих последовательностей у Capsicum. 121
3.2.3. Молекулярный анализ семейства генов протеинкиназ у представителей рода Capsicum 122
3.2.3.1. Общая характеристика полиморфизма последовательностей генома перца, содержащих киназный домен и выявленных при использовании метода РК-маркирования. 122
3.2.3.2. Использование метода РК-маркирования для определения филогении семейства генов протеинкиназ перца. 125
3.2.3.3. Анализ нуклеотидных последовательностей полиморфных РК- фрагментов. 126
3.3. Молекулярный анализ микросателлитных локусов генома перца. 128
3.3.1. Общая характеристика полиморфизма SSR-локусов хлоропластной ДНК. 128
3.3.2. Детекция полиморфизма ядерных микросателлитных локусов. 132
3.4. Исследование ну клеотидного полиморфизма последовательности гена 5.8S и транскрибируемых спейсерныхучастков (ITS1,1TS2) рибосомной ДНК видов рода Capsicum
Заключение 142
Выводы 146
Приложение 141
Список литературы 158
