Введение
Глава 1. Обзор литературы 8,
1.1. Lemnaceae: морфологическая, таксономическая и генетическая характеристика 8.
1.1.1. Ботаническая и таксономическая характеристика Lemnaceae 8.
1.1.2. Современная систематика и классификация семейства Lemnaceae 8.
1.1.3. Морфо-физиологическое описание представителей семейства Lemnaceae 9.
1.1.3.1. VojuLemna 10.
1.1.3.2. Род Spirodela 13.
1.1.3.3. PoRLandoltia 14.
lA.3.4.~PonWolffiella 14.
1.1.3.5. Род Wolffia 14.
1.1.4. Пути распространения Lemnaceae 15.
1.2. Использование Lemnaceae 15.
1.3. История филогении, систематики и таксономии Lemnaceae 16.
1.3.1. Таксономические и филогенетические отношения Lemnaceae 19.
1.3.2. Филогенетическое родство Lemnaceae и Агасеае
Существующие представления о возможном общем происхождении Lemnaceae и рода Pistia семейства Агасеае 24.
1.4. Геном растений и методы его исследования 28.
1.4.1. Уникальные последовательности генома растений 28.
1.4.2. Характеристика основных семейств генов растительного генома 29.
1.4.2.1. Семейство генов устойчивости растений 29.
1.4.2.2. Семейство MADS-box генов 31.
1.4.2.3. Семейство генов MYB транскрипционных факторов растений 31.
1.4.3. Молекулярные методы анализа растительного генома 32.
1.4.3.1. Метод AFLP-анализа 32.
1.4.3.2. Метод RAPD-анализа 33.
1.4.3.3. Метод DDP-анализа 33.
1.5. Исследование полиморфизма хлоропластного генома для определения таксономии и филогении растений 34.
1.6. Исследование полиморфизма митохондриального генома для определения таксономии и филогении растений 38.
Глава 2. Материалы и методы 41.
Глава 3. Результаты и обсуждение 47.
3.1. Молекулярный анализ ядерного генома Lemnaceae 47.
3.1.1. Анализ генома Lemnaceae RAPD методом 48.
3.1.2. Анализ генома Lemnaceae AFLP методом 52.
3.1.2.1. Подбор AFLP-комбинаций праймер/фермент, выявляющий внутри- и межвидовой полиморфизм у представителей Lemnaceae 52.
3.1.2.2. AFLP маркирование представителей Lemnaceae 53.
3.1.3. Комплексный анализ генетического разнообразия представителей Lemnaceae с использованием AFLP- и RAPD- систем молекулярного маркирования 55.
3.1.4. Молекулярный анализ основных адаптивно-значимых семейств
генов у представителей семейства Lemnaceae 58.
3.1.4.1. Молекулярный анализ семейства генов резистентности у
представителей Lemnaceae 58.
3.1.4.1.1. Подбор NBS-комбинаций праймер/фермент, выявляющий внутри- и межвидовой полиморфизм у представителей Lemnaceae 58.
3.1.4.1.2. NBS маркирование представителей Lemnaceae 59.
3.1.4.2. Молекулярный анализ семейства MADS-box генов и их аналогов у представителей Lemnaceae 63.
3.1.4.3. Молекулярный анализ семейства генов MYB факторов транскрипции у представителей Lemnaceae 67.
3.1.5. Сравнительный анализ полиморфизма адаптивно-значимых семейств генов и селективно-нейтральной части ядерного генома Lemnaceae 70.
3.1.6. Анализ полиморфизма гена рибосомального оперона J8Sy
представителей Lemnaceae 72.
Обсуждение полученных результатов 75.
3.1.7. Оценка внутривидовой полиморфизма Lemnaceae 82.
3.2. Анализ полиморфизма последовательностей хлоропластного генома Lemnaceae 87.
3.2.1. Полиморфизм последовательностей интрона гена rpSl 6 Lemnaceae 88.
3.2.2. Полиморфизм последовательностей спейсера trnT-trnY Lemnaceae 94.
3.2.3. Полиморфизм последовательностей спейсера trnT-trnL Lemnaceae 100.
3.2.4. Полиморфизм последовательностей спейсера trnh-tmF Lemnaceae 105.
3.2.5. Внутривидовой полиморфизм хлоропластного генома Lemnaceae на примере вида Spirodela polyrhiza 108.
3.2.6. Комбинированный анализ данных четырех областей хлоропластного генома Lemnaceae
(спейсеры trnT-trnL, trnT-trnY, trnL-trnFw интрон гена rpS16) 110.
Обсуждение полученных результатов по четырем областям хпДНК Lemnaceae 111.
3.3. Анализ полиморфизма последовательностей митохондриального генома Lemnaceae 117.
3.3.1. Характеристика протяженных инсерций в интроне Ъ/с гена nadl Lemnaceae 118.
3.3.2. Характеристика последовательности Ь/с интрона видов Lemnaceae 123.
3.3.3. Внутривидовой полиморфизм митохондриального генома у представителей Lemnaceae 125.
3.3.4. Анализ доменов интрона nadl представителей Lemnaceae 125.
3.3.5. Филогенетическое родство Lemnaceae и Агасеае на основе анализа полиморфизма интрона Ь/с гена nadl
митохондриального генома 129.
3.4. Филогенетические отношения у анализируемых видов Lemnaceae: данные молекулярного анализа ядерного, хлоропластного и
митохондриального геномов 134.
Заключение 136.
Основные выводы 139.
Список литературы
