Введение
1. Обзор литературы. Современные представления о ротавирусах и ротавирусной инфекции 11
1.1. Классификация ротавирусов 11
1.2. Структурная и молекулярная организация ротавируса 12
1.2.1. Морфология и свойства ротавирусной частицы 12
1.2.2. Геном ротавируса 15
1.2.3. Вирусные белки 17
1.2.3.1. Структурные белки 18
1.2.3.2. Неструктурные белки 24
1.3. Ротавирусная инфекция 28
1.3.1. Значимость ротавирусного гастроэнтерита в инфекционной патологии детей раннего возраста на современном этапе 29
1.3.2. Патофизиология ротавирусной инфекции 32
1.3.3. Клинические проявления ротавирусной инфекции 33
1.3.4. Лабораторная диагностика ротавирусной инфекции 35
1.4. Эпидемиология ротавирусной инфекции 37
1.4.1. Антигенная характеристика ротавирусов группы А 37
1.4.1.1. Механизмы изменчивости ротавирусов 39
1.4.1.2. Разнообразие [P]G генотипов ротавирусов 43
1.4.1.3. Инфицирование несколькими штаммами ротавируса 46
1.4.1.4. Зоонозный потенциал ротавирусной инфекции 47
1.4.1.5. Асимптоматическая форма ротавирусной инфекции 51
1.4.2. Сезонность ротавирусной инфекции 54
1.4.3. Пути передачи ротавирусной инфекции 55
1.4.4. Иммунитет при ротавирусной инфекции 57
1.5. Вакцинопрофилактика ротавирусной инфекции 60
1.6. Заключение 63
2. Материалы и методы 65
2.1. Основная характеристика обследованных больных 65
2.2. Методы 66
2.2.1. Иммуноферментный анализ 66
2.2.2. Получение осветленного экстракта фекалий 67
2.2.3. Выделение РНК вирусов 67
2.2.4. Реакция обратной транскрипции 67
2.2.5. Амплификация фрагментов кДНК 68
2.2.6. Электрофоретический анализ продуктов амплификации 73
2.2.7. Компьютерный анализ 74
2.2.8. Статистический анализ 84
3. Результаты и обсуждение 85
3.1. Оценка распространенности ротавирусной инфекции у детей раннего возраста в Новосибирске 85
3.2. Сравнительная оценка диагностической эффективности наборов реагентов для выявления ротавирусов группы А 89
3.3. Изучение особенностей ротавирусной инфекции у детей раннего возраста в Новосибирске с 2005 по 2008 г 92
3.3.1. Гастроэнтериты, вызванные ротавирусами группы А 94
3.3.2. Гастроэнтериты, вызванные ротавирусами группы С 103
3.4. Молекулярно-генетическая характеризация изолятов ротавирусов группы А 105
3.4.1. Характеризация Р- и G- генотипов ротавируса группы А, циркулировавших в Новосибирске 106
3.4.2. Динамика циркуляции ротавирусов разных [PJG-генотипов в Новосибирске 110
3.4.3. [P]G генотипы ротавирусов группы А, циркулировавших в Омской области 114
3.4.4. Филогенетический анализ нуклеотидных последовательностей кДНК фрагментов генома ротавирусов группы А 117
4. Заключение 148
5. Выводы 151
Приложение 153
Список литературы
