Введение
ГЛАВА 1. Обзор литературы 19
1.1. Особенности таксономии и биологии легионелл 19
1.1.1 Общая характеристика возбудителя 19
1.1.2 Особенности таксономии легионелл 23
1.1.3 Особенности биологии легионелл 28
1.2. Лабораторная диагностика легионеллёза 32
1.2.1 Выделение и идентификация культуры легионелл из клинического материала 34
1.2.2 Серологическая диагностика легионеллеза 39
1.2.3 Определение антигена легионелл в моче больных 41
1.2.4 Выявление легионелл в клиническом материале методом прямой иммунофлюоресценции 44
1.3 Экология легионелл в потенциально опасных водных системах 44
1.3.1 Легионеллы в воде и почве 45
1.3.2 Легионеллы и простейшие 50
1.3.3 Легионеллы и биопленки 52
1.3.4 Выделение легионеллы из окружающей среды 57
1.3.5 Методы контроля и мониторинга легионелл в потенциально опасных водных системах 59
1.4 Заключение 61
ГЛАВА 2. Материалы и методы 63
Материалы 63
2.1 Штаммы легионелл, клинический материал (бронхоаль- 63
веолярный лаваж, моча) Методы 74
2.2. Лабораторная диагностика легионеллёза 74
2.2.1 Определение антигена в моче 74
2.2.2 Микробиологическое исследование БАЛ 75
2.2.3 Применение ПЦР-РВ для диагностики легионеллезной инфекции у гематологических больных 76
2.3. Выявление легионелл в потенциально опасных водных объектах окружающей среды 78
2.3.1 Бактериологическое исследование воды и биопленок 78
2.3.2. Характеристика выделенных штаммов 81
2.3.2.1 Идентификация легионелл 81
2.3.2.2 Типирование легионелл с помощью панели моноклональ-ных антител 81
2.3.2.3 Секвенирование ДНК легионелл 83
2.4. Получение бактериальных биопленок 85
2.4.1. Получение моновидовых биопленок 85
2.4.2 Получение биопленок других микроорганизмов 86
2.4.3. Изучение природных биопленок 88
2.4.3.1 Высев из биопленок на легионеллы и другие микроорга низмы 88
2.4.3.2 Электронно-микроскопическая характеристика биопленок 88
2.5 Статистическая обработка результатов 89
ГЛАВА 3. Результаты исследований 90
3.1. Диагностика легионеллеза у больных тяжелыми пневмо ниями 90
3.1.1 Разработка алгоритма диагностики легионеллёза при вне-больничных пневмониях 90
3.1.2 Разработка алгоритма диагностики легионеллёза при лёгочных осложнениях у иммунокомпрометированных па 4
циентов 98
3.2. Разработка алгоритма выявления легионелл в окружаю щей среде 100
3.3. Применение разработанного алгоритма при расследова нии эпидемических вспышек легионеллёза 107
3.3.1. Применение разработанного алгоритма при расследовании вспышки внебольничного легионеллеза в Верхней Пышме 107
3.3.2. Применение разработанного алгоритма при анализе случаев пневмоний в ФГБУ «Гематологический научный центр» Министерства здравоохранения Российской Федерации 119
3.4. Изучение особенностей формирования модельных и при родных биопленок легионелл 127
3.4.1. Особенности формирования модельных биопленок в экспериментальных условиях 127
3.4.2. Изучение особенностей формирования биопленок в открытых (градирни промышленных предприятий) и закрытых (системы горячего водоснабжения общественных зданий) водных системах 134
3.5. Сравнительное изучение особенностей колонизации ле гионеллами 2-х типов потенциально опасных водных систем в регионах России 147
3.5.1. Особенности колонизации градирен промышленных предприятий 148
3.5.2. Особенности колонизации легионеллами систем водоснабжения общественных зданий 150
3.5.3. Серологическое разнообразие выделенных штаммов Le-gionella pneumophila, циркулирующих в градирнях и сис 5
темах водоснабжения в Российской Федера
ции 152
3.6. Создание национальной коллекции легионелл 157
Обсуждение 159
Выводы 178
Список литературы
