Введение
Часть 1. Изучение разнообразия бактерий микробиологическими методами и методом молекулярного клонирования 55
Микробиологический анализ образцов талого снега в районе станций Ленинградская и Дружная 55
Анализ таксономического состава микробного сообщества поверхностного снега в районе станций Ленинградская и Дружная 58
Анализ таксономического состава активно транскрибирующих бактерий Определение скорости включения радиоактивномеченных тимидина и лейцина 68
Часть 2. Изучение разнообразия антарктических микроорганизмов и особенностей их метаболизма анализом метагеномного секвенирования 70
Анализ библиотек фрагментов генов 16S рРНК 70
Метагеномный анализ сообществ антарктического снега 76
Анализ функциональных категорий генов в метагеномах поверхностного снега Антарктиды 80
Часть 3. Анализ разнообразия спейсеров в CRISPR локусах психрофильных антарктических бактерий Flavobacterium psychrophHum 86
Анализ типов CRISPR-Cas последовательностей в метагеномах антарктических микробных сообществ 86
Анализ разнообразия спейсеров F. psychrophilum, в трех различных областях Антарктики 88
Сравнительный анализ кластеров спейсеров антарктических F. psychrophilum с последовательностями в общедоступных базах данных 93
Заключение 96
Выводы 97
Список использованной литературы 98
Приложение 117
Благодарности 1
