Введение
Глава 1 Обзор литературы
1.1 Эволюция принципов классификации, идентификации и установления аутентичности бактерий
1.2 Современные способы консервации бактерий в коллекционных центрах
1.3 Использование коллекционных штаммов патогенных микроорганизмов в научно-исследовательской деятельности и практике здравоохранения
Глава 2 Материалы и методы
2.1 Штаммы бактерий I – IV групп патогенности и их культивирование 40
2.2 Используемые химические реагенты 45
2.3 Изучение культурально-морфологических, фенотипических, молекулярно-генетических и серологических свойств коллекционных тест-штаммов патогенных микроорганизмов 46
2.4 Идентификация микроорганизмов на основании биохимической активности
2.4.1 Использование дифференциально-диагностических сред Гисса 46
2.4.2 Использование систем индикаторных бумажных (СИБ) 47
2.4.3 Использование АРI систем 48
2.4.4 Использование анализатора VITEK 2 Compact
2.5 Идентификация микроорганизмов с помощью автоматической 50 системы рибопринтинга (RiboPrinter System)
2.6 Идентификация микроорганизмов с помощью MALDIOF масс- спектрометрии
2.7 Использование серологических методов для идентификации бактерий родов Shigella и Salmonella
2.8 Лиофилизация бактериальных клеток на сублимационных установках камерного и коллекторного типов
2.9 Низкотемпературная консервация бактерий I-IV групп патогенности
Глава 3 Определение аутентичности и таксономической принадлежности коллекционных тест-штаммов патогенных микроорганизмов
3.1 Культурально-морфологические и тинкториальные свойства тест - штаммов патогенных микроорганизмов
3.2 Определение биохимических показателей тест - штаммов патогенных микроорганизмов
3.3 Поиск маркеров аутентичности коллекционных тест-штаммов патогенных микроорганизмов, ассоциированных с их биохимической активностью
3.4 Идентификация тест-штаммов патогенных микроорганизмов с помощью MALDIOF масс-спектрометрии
3.5 Риботипирование на автоматической станции Dupont Qualicon RiboPrinterSystem
Глава 4 Разработка алгоритма установления аутентичности референтных штаммов патогенных микроорганизмов и создание базы данных для его выполнения
4.1 Создание базы данных результатов научных исследований тест- штаммов патогенных микроорганизмов и её использование в установлении их аутентичности
4.2 Разработка алгоритма установления аутентичности и таксономической принадлежности тест-штаммов
Глава 5 Разработка схемы процесса консервации коллекционных тест- 101 штаммов патогенных бактерий
5.1 Лиофилизация патогенных бактерий на установках камерного и 102 коллекторного типа
5.2 Оптимизация способа низкотемпературной консервации референтных штаммов при температуре минус 70 С в Государственной коллекции патогенных бактерий ФКУЗ РосНИПЧИ «Микроб»
Заключение 133
Практические рекомендации 133
Перспективы дальнейшей разработки 133
Выводы 144
Список литературы
